利用GenBank数据库开发泥鳅EST-SSR标记任务书

 2023-05-11 14:41:06

1. 毕业设计(论文)的内容和要求

目标:

1、从genbank 数据库中筛选泥鳅est微卫星位点。

2、针对已筛选出的微卫星位点设计50对以上微卫星引物,为今后泥鳅遗传多样性分析、功能基因定位、遗传图谱构建以及比较基因组等研究研究奠定基础。

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2. 实验内容和要求

内容:

1、从genbank中下载泥鳅est序列;

2、在下载的est序列中筛选含微卫星的序列;

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3. 参考文献

[1] 陈钢铭, 王卫民, 曹小娟. 微卫星标记快速鉴别幼鱼阶段的 泥鳅与大鳞副泥鳅[j]. 华中农业大学学报, 2013, 32(6): 117-120

[2] 谢皓, 陈学珍, 杨柳, 等. est-ssr标记的发展和在植物遗传研究中的应用[j]. 北京农学院学报, 2005, 20(4): 73-76

[3] 匡刚桥, 刘臻, 鲁双庆, 等. genbank数据库中鳜鱼微卫星位点的筛选及特征分析[j]. 动物学报, 2007, 53(1): 184-189

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4. 毕业设计(论文)计划

进度安排:

2022年11月-12月:选题及资料搜集;

2022年1月-3月:进行序列下载、微卫星查找及引物设计;

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