水稻、玉米和拟南芥RIO非典型蛋白激酶家族的鉴定和表达分析任务书

1. 毕业设计（论文）的内容和要求

1. 掌握植物基因家族成员的鉴定、系统发育和表达分析方法。

2. 鉴定出水稻、玉米和拟南芥基因组中的RIO基因，明确其进化历史与机制，以及在不同组织器官中的时空表达模式。

2. 实验内容和要求

1. 水稻、玉米和拟南芥中rio基因的系统鉴定。

通过关键词搜索、blast比对等手段鉴定出水稻、玉米和拟南芥中rio家族所有成员；2. 基因复制事件和系统发育分析。

通过分析rio非典型蛋白激酶家族的基因复制事件和系统发育关系，明确该家族的进化历史与机制；3. 基因表达模式分析。

3. 参考文献

[1] laronde-leblanc n, wlodawer a. the rio kinases: an atypical protein kinase family required for ribosome biogenesis and cell cycle progression[j]. bba-proteins and proteomics, 2005, 1754(1-2):14-24.

[2] laronde-leblanc n, wlodawer a. a family portrait of the rio kinases[j]. j. biol. chem., 2005, 280(45):37297-37300.

[3] esser d, siebers b. atypical protein kinases of the rio family in archaea[j]. biochem. soc. t., 2013, 41(1):399-404.

4. 毕业设计（论文）计划

2022年11月-2022年12月，查阅相关文献，熟悉各种生物信息学数据库和软件；2022年1月-2022年3月，完善技术路线，开展各种分析；2022年4月-2022年5月，分析和整理实验结果，撰写论文。