水稻TIFY基因家族的鉴定和表达分析任务书

1. 毕业设计（论文）的内容和要求

1. 掌握植物基因家族成员的鉴定、系统发育和表达分析方法。

2. 鉴定出水稻基因组中的TIFY基因，明确其进化历史与机制及在不同组织器官中的表达模式。

2. 实验内容和要求

1. 水稻tify基因的系统鉴定。

通过blast比对搜索及pfam验证，鉴定出水稻中tify家族所有成员；2. 基因复制事件和系统发育分析。

通过分析tify家族的基因复制事件和系统发育关系，明确该家族的进化历史与机制；3. 基因表达模式分析。

3. 参考文献

[1] ye hy, du h, tang n, et.al. identification and expression profiling analysis of tify family genes involved in stress and phytohormone responses in rice [j]. j.mol. biol., 2009, 71(3):291-305

[2] bai yh, meng yj, huang dl, et al. origin and evolutionary analysis of the plant-specific tify transcription factor family [j]. genomics, 2011, 98 (2): 128-136

[3] zhu d, bai x, luo x, et al. identification of wild soybean (glycine soja) tify family genes and their expression profiling analysis under bicarbonate stress [j]. plant cell rep., 2013, 32(2): 263-272

4. 毕业设计（论文）计划

2022年11月-2022年12月，查阅相关文献，熟悉各种生物信息学数据库和软件；2022年1月-2022年3月，完善技术路线，开展各种分析；2022年4月-2022年5月，分析和整理实验结果，撰写论文。