- 文献综述(或调研报告):
基于群感淬灭的内生链霉菌工程菌株构建的研究背景综述
摘要:马铃薯疮痂病是由疮痂链霉菌的群体感应效应引起的一种农害病,而来自细菌的attM基因产物AttM能降解群体感应信号分子gamma;-丁内酯,使群体感应淬灭,从而治理马铃薯疮痂病。我们利用前期已获取的attM基因、eGFP基因和已构建完毕的pIJ8600穿梭质粒,在含辅助质粒的菌株E.coli ET12567/pUZ8002的帮助下将pIJ8600-attM-egfp转化进入内生链霉菌孢子,最终得到能够成功分泌AttM的内生链霉菌。本文主要介绍群体感应和群感淬灭的原理,以及选用eGFP基因作为标记基因的理论基础。
关键词:群体感应 信号分子
一、群体感应
上世纪70年代,人们发现费氏弧菌在鱼或乌贼的器官中繁殖时,会出现发光现象。当它们在器官中大量存在时,发光就会开始;当它们离开时,发光现象也随即停止。这种“生物发光”现象在1994年被叫做群体感应:指微生物群体在其生长过程中,由于群体密度的增加,导致其生理生化特性的变化,显示出少量菌体或单个菌所不具备的特征。这个变化的原因在于:当环境中微生物种群密度达到阈值,信号分子的浓度也达到一定的水平,通过包括受体蛋白在内的相关蛋白的信号传递,诱导或抑制信号最终传递到胞内,影响特定基因的表达,调控微生物群体的生理特征,如生物发光、抗生素合成、生物膜形成等。这解释了为什么费氏弧菌在海洋漂浮不会产生光——它们被稀释了。
群体感应的调控机制:负责费氏弧菌群体感应的信号分子是3O,C6-HSL。当费氏弧菌的密度较低时,3O,C6-HSL的浓度也较低,无法与对应受体蛋白LuxN结合,LuxN将自身的一个磷酸分子通过LuxU蛋白转移给应答调节子LuxO。磷酸化的LuxO与sigma;54结合,激活编码sRNAs的基因表达。产生的sRNAs与RNA伴侣蛋白Hfq一起作用,使得翻译LuxR的mRNA降解,而LuxR正是发光基因表达所必需的转录激活因子,因而在这种情况下,没有发光现象。在费氏弧菌密度升高时,3O,C6-HSL的浓度达到阈值,磷酸基团逆向流动,sRNAs不表达,LuxR的mRNA得以稳定存在和翻译,最终LuxR与lux启动子结合激活整个lux操纵子,费氏弧菌发光。
lux操纵子编码荧光素酶或黄素还原酶,从癸醛或其他脂肪醛的水解得到生物荧光。这一过程十分消耗能量,因为lux基因也编码了脂肪醛合成。然而,这种生物发光在进化过程中还是被保留了下来。一个可能的原因是鱼和费氏弧菌的协作共生。这种动物为细菌提供了一种排他性的、富含碳的生态位。而细菌会发光,这是一种既能吸引猎物又能在深海环境中阻止捕食者的功能。
群体感应的信号分子根据作用对象和分子组成可分为:
(1)革兰氏阴性细菌的酰基高丝氨酸内酯化合物(acyl-homoserinelactone,AHL)信号分子。AHL类分子具有一个共同的高丝氨酸内酯环头部,不同的AHL分子具有不同的酰基侧链尾巴,差异可能在于侧链长短和取代基不同,这也造成了微生物在利用AHL信号分子时具有一定的特异性。这类信号分子广泛存在于根际微生物、肠道微生物、海洋微生物等微生物类群中。费氏弧菌的3O,C6-HSL就属于AHL。
