双荧光素酶报告基因检测lncRNA-119414和miR686之间的相互作用文献综述

 2023-02-13 10:02

lncRNA的作用机制研究

摘要:lncRNA(10ng non-coding RNA)是长度大于200个核苷酸的非编码RNA,通过与DNA、RNA和蛋白质相互作用在转录水平、转录后水平、表观遗传水平各个层面调控基因表达,进而参与细胞周期调控、细胞分化调控和免疫应答等生理过程。越来越多的研究表明,lncRNA的表达失调与SLE、MS等自身免疫性疾病的发生息息相关。细胞定位对 lncRNA 发挥分子功能的机制有重要影响。胞质中的lncRNA主要作为ceRNA或者miRNA前体分子调控miRNA靶基因的表达,此外还可以通过与蛋白质相互作用调控其活性或定位;细胞核内的lncRNA可作为信号(signal)、诱饵(decoy)、引导(guide)、支架(scaffold)调控特定基因的表观遗传状态及转录活性。了解其亚细胞定位与作用机制之间的关联,将推动lncRNA在多种疾病包括自身免疫性疾病中的深入研究,将为探索新发现lncRNA的作用机制和生物学功能提供便利,有助于完善多种疾病包括自身免疫性疾病的病因学及治疗方案。本文就lncRNA作用机制与其在疾病发生发展中的作用的研究进展作一综述。

关键词:lncRNA ;ceRNA ;作用机制;自身免疫病;肿瘤

最初lncRNA(Long non-coding RNA)被认为是不具有生物学功能的基因转录噪音,但近年来lncRNA的许多重要功能逐渐被发现,包括调控基因表达、调控蛋白质活性等,这些功能与细胞结构完整性、细胞分化、细胞周期和免疫应答等生命活动息息相关,并影响了胚胎发育、物质代谢与癌症、AID等疾病的发生等生理病理过程[1]。lncRNA的亚细胞定位不同往往涉及不同的作用机制,了解其亚细胞定位与作用机制之间的关联,将推动lncRNA在多种疾病包括自身免疫性疾病中的深入研究,将为探索新发现lncRNA的作用机制和生物学功能提供便利,有助于完善多种疾病包括自身免疫性疾病的病因学及治疗方案。本文就lncRNA作用机制与其在AID发生发展中的作用的研究进展作一综述。

一、lncRNA简介

lncRNA(Long non-coding RNA),是长度大于200个核苷酸的非编码RNA。在哺乳动物中,lncRNA由RNA聚合酶II转录,经历剪接或非剪接、加或不加多聚赖氨酸尾等过程成为成熟lncRNA,定位于细胞核或细胞质中,作用机制复杂多变。相比于mRNA,表达更具有细胞特异性、组织特异性和发育阶段特异性等特征。其命名可根据与疾病的关系、与周围基因的位置、与基因上下游调控关系、参与的生物学功能、在细胞内的定位来确定。根据它们在基因组上相对于蛋白编码基因的位置,lncRNA可以分为六类[2]:①Antisense lncRNA (反义lncRNA),反义转录产物,与相反链上的转录产物部分或完全互补;②SenselncRNA(正义lncRNA);③Large intergenic noncoding RNA (基因间lincRNA),由位于蛋白质编码基因之间的序列独立转录;④Bidirectional lncRNA (双向lncRNA),双向转录产物,与蛋白质编码基因共享相同的启动子,但转录方向相反;⑤Intronic transcript lncRNA (内含子lncRNA),由基因的内含子产生,⑥Enhancer lncRNA (增强子lncRNA),由蛋白质编码基因的增强子区域产生。

lncRNA与生物学功能密切相关,参与了X染色体沉默、基因组印记以及染色质修饰、转录激活、转录干扰、核内运输等多种重要过程,调控基因表达,并参与物种进化、胚胎发育、物质代谢。此外,在表观遗传调控、细胞周期调控和细胞分化调控等众多生命活动中发挥重要作用,与一些疾病的发展历程也有关系[3]。在研究 lncRNA 功能的过程中,研究方法的建立和应用起着非常重要的作用。目前用于 lncRNA 研究的主要方法有:微阵列、转录组测序、Northern 印迹、实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应、荧光原位杂交、RNA 干扰和 RNA 结合蛋白免疫沉淀等。

二、lncRNA作用机制

lncRNA可调控的分子形式多样,具有更为复杂而全面的调控方式网络,能够在转录水平、转录后水平、表观遗传水平各个层面发挥调控基因表达的功能,lncRNA的不同亚细胞定位往往涉及不同的作用机制。

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