以RSK2为靶点的天然产物潜在抑制剂的找寻开题报告

 2022-03-08 19:26:23

1. 研究目的与意义

癌症,因其高发病率和高死亡率,严重危害人民群众的身心健康[1]。仅以乳腺癌为例,我国每年大约新增乳腺癌患者27.9万例,位居女性肿瘤发病率首位。虽然乳腺癌患者的5位存活期已提升至80%左右,但与欧美发达国家相比,仍有较大的提升空间[2-4]。因此,深入研究了解乳腺癌中的原癌基因及其作用机制,有利于新型抗乳腺癌药物和治疗手段的开发。

核糖体s6激酶2(ribosomals6kinase, rsk2),属于ras-mapk下游通路的90kda的rsk家族,rsk2被磷酸化后,被转入到细胞核中,参与调控细胞的增殖、周期、转化等过程。rsk2的结构比较复杂,包含2个功能不同的激酶结构域,分别是n端激酶结构域(n-terminalkinasedomain,ntkd)与c端激酶结构域(c-terminalkinasedomain,ctkd);另有1个铰链区(linkerregion,lr)、1个n端结构域(n-terminaldomain,ntd)及1个c端结构域(c-terminaldomain,ctd)。ntkd属于agc激酶家族,主要负责底物的磷酸化。ctkd则属于camks家族,主要负责自身的磷酸化(活化)。2个激酶结构域由1个保守的铰链结构相连,在ctd上有1个erk1/2对接基序(leu-arg-gln-arg-arg),而lr中包含erk介导的rsk2自动磷酸化位点。大量研究表明,rsk2在多种恶性肿瘤及组织中较正常细胞及组织明显偏高,在不同的肿瘤中扮演不同的角色,如在乳腺癌、骨肉瘤中参与细胞增殖,而在头颈部鳞癌参与肿瘤转移、侵袭。因此,rsk2成为潜在的抗肿瘤靶标。本论文以rsk2为蛋白受体,采用igemdock等分子对接软件,从白术、蔓荆子、枇杷叶等不同中草药中筛选找寻潜在抑制剂。

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2. 研究内容和预期目标

1.从pdb中,找寻rsk2蛋白的晶体结构;

2.结合已知的rsk2功能区域,分析其结构域;

3.从已知文献中找寻白术、蔓荆子、枇杷叶等不同中草药的有效成分;

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3. 研究的方法与步骤

a. 查阅文献,写出开题报告(第1-2周)

根据论文题目,查阅正式出版的中外学术期刊和专著,从中选择10篇以上参考文献(外文1-2篇),认真阅读,深刻理解,综合分析,掌握其最新动态,参照论文设计任务书的研究内容,写出开题报告(包括文献综述、选题目的和意义、研究方案、计划进度、参考文献)。论文撰写的格式按照院统一标准。如参考文献要列出作者姓名(多人的取前三名)、论文标题、发表刊物、时间、卷(期)及起止页码。在查阅的文献中选1篇外文(5000以上外文印刷字符、文献内容要结合本研究内容)全文翻译为中文。

b. 实验研究前期准备工作(7周前)

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4. 参考文献

1.Shan X, Fu YS, Aziz F, et al. Ginsenoside Rg3 inhibits melanoma cell proliferation through down regulation of histone deacetylase 3(HDAC3) and increase of p53 acetylation. PLoS One. 2014, 9(12): e115401.

2.Waterman C, Calcul L, Beau J, et al. Miniaturized cultivation of microbiota for antimalarial drug discovery. Med Res Rev. 2014, doi:10.1002.

5. 计划与进度安排

2022-2022-2学期第1-2周查阅文献,完成开题报告的撰写。

第3-4周 找寻rsk2蛋白晶体结构,并分析其功能域;

第5-7周找寻白术、蔓荆子、枇杷叶等中草药的有效成分;

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