水稻cystatin基因家族的生物信息学分析任务书

1. 毕业设计（论文）的内容和要求

1.掌握植物基因家族成员的鉴定、系统发育和表达分析方法。

2.鉴定出水稻基因组中的cystatin基因，明确其进化历史与机制，及在不同组织器官中的表达情况。

2. 实验内容和要求

1. 水稻cystatin基因的系统鉴定。通过关键词搜索、blast比对等手段鉴定出水稻cystatin家族所有成员；

2. 基因复制事件和系统发育分析。通过分析水稻cystatin家族的基因复制事件和系统发育关系，明确该家族的进化历史与机制；

3. 基因表达分析。通过检索水稻基因表达数据库，明确cystatin基因在水稻不同组织器官中的表达模式。

3. 参考文献

[1] Kondo H,Abe K, Emori Y,et al.Gene organization of oryza cystatin,a new cystatin superfamily member of plant origin,is closely related to that of oryza cystatin but different from those of animal cystatins [J].FEBS Lett,1991,278(1):87-90.

[2] 马建平, 牟志美. 植物蛋白酶抑制剂的研究进展[J].中国蚕业, 2006, 27(3): 4-8.

4. 毕业设计（论文）计划

2013年11月-2013年12月，查阅相关文献，熟悉各种生物信息学数据库和软件；

2022年1月-2022年3月，完善技术路线，开展各种分析；

2022年4月-2022年5月，分析和整理实验结果，撰写论文。