拟南芥表观遗传的生物信息学研究开题报告

1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）

1研究意义、本课题的意义、国内外研究概况、应用前景等

1.1研究背景及意义

（1）环丙基固醇异构酶cpi1

2. 研究的基本内容和问题

2研究目标、内容、拟解决的关键问题

2.1研究内容及目标

拟南芥中cpi1基因在拟南芥的第五号染色体上，它的atg编号为at5g50375.基因组序列包含8个外显子和7个内含子。cds序列长度为843bp。它编码的蛋白的主要功能是催化五环的环丙基固醇合成四环的固醇。cpi1为膜蛋白，根据smart软件预测有4到7个跨膜结构域，含有一个潜在的信号区域。到目前为止，拟南芥基因组还未发现cpi1的其他同源基因，这说明拟南芥的cpi基因是单拷贝基因。环丙基固醇异构酶（cyclopropylsterolisomerase1,cpi1）是催化植物固醇合成途径中的关键酶。在植物中起到催化环丙烷环打开形成固醇的骨架的作用，这是植物特有的酶，也是植物固醇合成途径的一个限速酶。

3. 研究的方法与方案

3研究方法、技术路线、实验方案及可行性分析

3.1研究方法

3.1.1亚硝酸盐法测序

4. 研究创新点

本实验采用生物信息学方法，相比与传统方法更加快捷，成本更低，更具可行性。

5. 研究计划与进展

2014年5月份完成