针对全基因组测序的细菌DNA大量提取最优方法的探索开题报告

1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）

随着分子生物学的不断发展, 核酸技术已在生物学各领域得到广泛应用, 细菌dna 的提取日益成为一种常规的实验手段。

作为分子生物学研究的第一步, 样品dna 的提取显得尤为重要。

提取dna 的总量、成分、纯度、片段大小，将对后续工作产生影响，比如接下来的pcr、16s rdna扩增，以及pcr-dgge分析等。

2. 研究的基本内容和问题

研究目标1、研究不同方法对目标菌株基因组dna的提取效果。

2、探索基因组dna提取方法的改良方案，寻找更为高效且方便实用的方法。

主要内容1、以不同方法提取目标菌株的基因组dna；2、测量不同方法获得的dna的浓度，od280，od260及od230；3、通过16srdna的pcr来验证提取方法的可行性；4、总结实验中遇到的问题并针对这些问题寻找可行的方案来改善提取方法。

3. 研究的方法与方案

实验方案（1）培养目标菌株 使用lb培养基隔夜培养目标菌株，使其达到要求浓度。

（2）取两管共50ml菌液，8000rpm离心，te溶液重悬，采用试剂盒法提取dna，试剂盒选用genray公司的细菌基因组dna提取试剂盒（离心柱型）。

（3）如上取菌液，离心，重悬，分别再采用水煮法和酶解法提取dna。

4. 研究创新点

提取DNA是分子生物学最基础的一步，是之后的实验的基石，本实验旨在探究使用方便简洁，对仪器和设备要求不高，并能有良好提取效果的DNA提取方法，能为其它分子生物学实验提供参考。

5. 研究计划与进展

2014年3月，菌株的培养；2014年3月-2014年4月，不同方法提取DNA，并电泳以及测定纯度、浓度；2014年4月，16srDNA PCR扩增验证；2014年5月，数据整理，论文写作。