1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）
1.本课题的研究意义
哺乳动物胃肠道是一个多样而复杂的生态系统，存在着数量巨大、种类繁多的微生物。研究表明哺乳动物胃肠道菌群总量大约为1014个，由500-1000种细菌组成[1]。这些微生物与肠道环境形成一个相对动态平衡,可根据食物和进入的微生物的特点做出反应,以功能的多样性和较大的适应性来应对外界环境的改变[2]，对宿主的生长和健康起着重要的作用[3]。肠道微生物菌群的紊乱可导致肥胖、糖尿病、过敏等疾病的发生[4]。因此，对哺乳动物胃肠道微生物研究已经成为当前研究热点。
我们采用基于聚合酶链反应的变形梯度凝胶电泳（pcr-dgge）技术，较传统培养微生物的方法，不但避免了传统上耗时的菌种分离，更能分析无法用传统方法分离出来的细菌，自然界中有90%-99%的微生物无法用传统方法培养出来[5]。pcr-dgge技术为我们揭示哺乳动物肠道微生物区系的遗传多样性和种群差异性提供了简便而快捷的方式。
2. 研究的基本内容和问题
1.研究目标
1.1根据不同食性，分类对草食、肉食、杂食哺乳动物粪便菌群，用pcr-dgge技术进行多样性分析，并从肠道微生物角度推测他们的亲缘关系
1.2 通过对粪便样品中至少4类代表菌（厚壁菌门、拟杆菌门、甲烷菌、硫还原菌）的肠道菌群分析，探索这些菌的功能、尤其是对宿主生长状况和环境的影响，为微生态制剂和新兴技术粪便移植、甲烷菌储电及疾病监控提供一些借鉴。
3. 研究的方法与方案
1.研究方法和方案
1.1 采样
此次实验是对动物园样品中不同食性哺乳动物粪便进行研究，样品由当地动物园提供，我们在饲养员帮助下采样。粪便样品来自于南京红山动物园所饲养象、河马、斑马、长颈鹿、熊猫、金丝猴、环尾狐猴、黑白狐猴、小黑猩猩、丝猩猩、黑熊、亚洲黑熊、马来熊、小熊猫、东北虎、黑虎、美洲黑豹若干只。采样时，在其排便后，立即用无菌镊子将粪便中间部分放入无菌袋中并置于冰盒中，带回实验室-80℃保存，以备分离。
4. 研究创新点
1.1研究对象及方法新颖独到
本次实验的研究对象为不同种圈养野生动物粪便微生物菌群，国内外很少有涉及珍稀动物粪样微生物研究的，研究对象标新立异；采用pcr技术，dgge图谱分析技术，对粪样中微生物种群进行细致研究，全面分析不同种动物粪便微生物菌群之间的特异性和差异性。
1.2研究意义重大
5. 研究计划与进展
第一阶段（2015.92015.11）实验准备及完成dna的提取
第二阶段（2015.112015.12）完成常规指标测定及学习dgge技术
第三阶段（2015.122016.1）完成dgge并对其进行图谱分析
