1. 研究目的与意义
目的:运用生物信息学技术对极耐热木聚糖酶系统发育进行研究,分析已有记录中的耐热菌所产生的极耐热木聚糖酶系统并对极耐热木聚糖酶系统发育形态进行预测,本研究着重研究xyn10的结构,为xyn10的应用提供理论依据。
意义:为进一步探索极耐热木聚糖酶系统发育及xyn10的应用打下较好的基础。
2. 国内外研究现状分析
目前极耐热木聚糖酶已经被人们开发利用于连续生产单一成分低聚木糖,随着关于极耐热木聚糖酶的酶学性质研究的不断进步,在低聚木糖制备、焙烤食品品质改善、制浆造纸行业等方面的应用,取得了非常好的效果。国内外均已有相关方面的研究及相关文献资料报道,对极耐热木聚糖酶的生物信息学研究进一步促进了极耐热木聚糖酶的生产和应用方面的发展。
3. 研究的基本内容与计划
内容:掌握从美国国家生物信息中心查找基因序列的方法,从中大量获得极耐热木聚糖酶的基因序列。掌握如何使用clustal软件对基因序列进行比对,能熟练使用dnasp软件和modeltest软件,其中dnsp软件分析它们的变异位点,modeltest软件选择合适的模型,掌握paup软件构建nj、mp树的方法以及bayes软件建立bayes树的方法。通过系统发育研究以及氨基酸的一级结构,探讨耐热酶与酶活性之间的关系。
计划:
2011.02.13~2011.02.26了解生物信息学知识,完成开题报告
4. 研究创新点
极耐热木聚糖酶是耐热菌分泌产生的,在高温环境中能够水解木聚糖,因此具有极高的应用价值。从生物信息学角度分析极耐热木聚糖酶系统发育,应用Clustal软件、DNASP软件、Modeltest软件、Paup软件和Bayes软件通过计算机找到极耐热木聚糖酶系统的发育规律,根据已有数据简化实验步骤,通过此种途径及氨基酸的一级结构的研究探讨耐热酶与酶活性之间的关系。
