水稻自然群体穗瘟抗性的GWAS分析开题报告

 2022-02-08 20:10:36

1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)

由稻瘟病菌(magnaporthe oryzae)引起的稻瘟病是一种世界性的稻作病害,在世界各个水稻生产国或地区每年都有不同程度的发生[1]。

据统计,在1975-1990年的16年间,由稻瘟病引起的全球产量损失高达1.57亿吨[2],在东南亚每年由稻瘟病造成的经济损失达6000万欧元[3],在中国每年都有几个稻作区中等或偏重流行,且过去的20年有增长的趋势[3-4]。

据全国农作物重大病虫害预警,2012年稻瘟病在中国的发病面积将为533万hm2,较2011年增加20%[5]。

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2. 研究的基本内容和问题

来自全世界不同地区的有着丰富多样遗传背景的400种材料,其中蕴含着丰富的稻瘟病抗性资源,本研究将主要对这些不同材料进行穗瘟抗性鉴定,并进行全基因组关联分析(GWAS),试找出具有优良抗性的材料。

3. 研究的方法与方案

研究方法水稻穗瘟鉴定标准体系(1)接种时间:阴天或傍晚;剑叶与倒二叶叶舌间距为5cm左右。

(2)孢子液浓度:2-3105个/ml(3)接种量:2-3ml(4)接种方法:使用医院注射器(0.732mm)从包颈的叶鞘穗颈部位将菌液注入,直至菌液充满包穗。

(5)调查时间:接种后第3周(6)病级划分:依据发病率划分(irri,1996)0级,无病(高抗) 1级,发病率低于5%(抗)2级,发病率为5.1%-10%(中抗)3级,发病率为10.1%-25%(中感)4级,发病率为25.1%-50%(感)5级,发病率为50%以上(高感)技术路线:穗瘟病菌的培养---->水稻孕穗期接种穗瘟病菌---->样本收集---->抗病性鉴定---->数据分析

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4. 研究创新点

随着生物学技术的快速发展,人为的选择更为严格,导致品种遗传多样性大大降低。

普通的常规品种所具有的抗性基因已经满足不了当前的生产需求,要想得到具有广谱性、持久性抗性基因,就需要将目光投向野生资源和古老的地方品种中去发掘抗病基因。

本实验采用了400份来自全世界不同地区的种质材料,具有丰富的遗传多样性,利用北1、粳13-37、a、g四种稻瘟病菌对其进行抗病性鉴定,可以在同一次实验中验证四种不同生理小种的抗性情况,并进行全基因组关联分析(gwas)。

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5. 研究计划与进展

2017.5-2017.6 穗瘟病菌的培养2017.7-2017.8 水稻孕穗期接种稻瘟病菌2017.8-2017.9 收取样本 2017.9-2017.10 抗病性鉴定及统计2017.11-2017.12 数据分析2018.1-2018.3 论文撰写

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