基于毒素-抗毒素系统强化菌株B6-2降解芳香族化合物研究开题报告

 2022-02-11 22:38:53

1. 研究目的与意义

一、研究背景:

毒素-抗毒素系统(toxin-antitoxin systems,ta systems)广泛存在于微生物基因组中, 通常由两个共转录的基因组成,分别是编码稳定的毒素分子(toxin)和编码不稳定的抗毒素分子(antitoxin)。ta系统最早于1983 年发现于致病性大肠杆菌的低拷贝大质粒 f质粒上,用于维持质粒的稳定,但未引起人们的重视。目前研究表明,ta系统具有多种生物学功能,可能在细菌应激应答、程序性细胞死亡、多重耐药的形成等方面有重要的作用。

多环芳烃(polycyclic aromatichydrocarbons, pahs)是在环境中广泛分布的难降解污染物。它具有致癌、致畸、致突变毒性及环境激素活性,能够通过食物链富集作用进入高等动物体内。pahs在环境中主要靠特殊微生物资源的降解作用完成自然消减。因此,联苯(bp)可被选作pahs的模式化合物来研究pahs的微生物降解过程。

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2. 研究内容和预期目标

一、研究内容:

通过在菌株b6-2中失活毒素蛋白,探究该菌株对环境的适应性及对pahs的降解能力。

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3. 研究的方法与步骤

一、实验材料:

1、培养基

LB培养基:蛋白胨1%;酵母粉0.5%;NaCl 1%;pH 7.0-7.2。

无机盐培养基:K2HPO4·3H2O0.52%;KH2PO4 0.37%;Na2SO4 0.1%;MgSO4·7H2O 0.02%;NH4Cl0.2%;微量金属盐溶液 0.5;pH 7.0,121℃灭菌。

2、酶

各种限制性内切酶和各种修饰酶等。

二、实验方法:

1、菌株制备

利用联苯(BP),经过连续富集培养,筛选出生长迅速的菌株B6-2。

2、载体构建

采用碱裂解法小量提取质粒→PCR获得目的基因→纯化→酶切→连接→转化→重组子筛选及酶切鉴定

3、双亲杂交

4、菌株降解PAHs能力考查

4. 参考文献

[1]. overgaard m,borch j, gerdes k. relb and rele of escherichia coli, form a tight complex thatrepresses transcription via the ribbon–helix–helix motif in relb[j]. journal ofmolecular biology, 2009, 394(2):183-196.

[2]. pandey d p,gerdes k. toxin-antitoxin loci are highly abundant in free-living but lost fromhost-associated prokaryotes. [j]. nucleic acids research, 2005, 33(3):966-976.

[3]. schuster c f,bertram r. toxin-antitoxin systems are ubiquitous and versatile modulators ofprokaryotic cell fate[j]. fems microbiology letters, 2013, 340(2):73-85.

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5. 计划与进度安排

一、查阅文献,写出开题报告(2022年3月15日前完成)

根据论文题目,查阅正式出版的中外学术期刊和专著,从中选择10篇以上参考文献(外文1-2篇或以上),认真阅读,深刻理解,综合分析,掌握其最新动态,参照论文设计任务书的研究内容,写出开题报告。如参考文献要列出作者姓名、论文标题、发表刊物、时间、卷(期)及起止页码。在查阅的文献中选1篇外文(5000以上外文印刷字符、文献内容要结合本研究内容)全文翻译为中文。

二、实验研究前期准备工作(2022年12月24日到2022年3月15日)

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