1. 研究目的与意义
| 本课题研究的背景 食道癌是一种极具侵袭性、转移性和致命性的恶性肿瘤。我国是食管癌高发的国家，全球49.0%的食管癌发生在中国，每年食管癌新发病例超过22万例，死亡约20万例。我国食管癌高发省份为河北、河南、山西、福建，其次为新疆、江苏、甘肃和安徽等。食道癌发病率随着年龄而增长，多发生在40-70岁之间，男性多于女性，农村发病率高于城市。 目前认为食管癌的发生发展是饮食与生活方式、人口学因素、环境与遗传因素、感染因素等若干因素协同作用的结果。食道癌按照组织学分型可分为鳞状细胞癌、腺癌、未分化癌，其中未分化癌较少见，但恶性程度高。食管上、中段癌肿绝大多数为鳞状细胞癌，食管下段癌肿则多为腺癌。西方国家以腺癌多见，而我国则以鳞状细胞癌为主。 食管癌依据肿瘤的类型、位置、分化程度、淋巴结转移和远处转移的情况，可以分为五期，即0期、Ⅰ期、Ⅱ期、Ⅲ期和Ⅳ期，以往为了临床使用方便又常简单的分为早中晚三期。早期食管癌就相当于0到Ⅰ期，主要是指肿瘤侵犯黏膜和黏膜下层，肿瘤大小一般小于三公分，局部淋巴结没有转移的患者，中期相当于Ⅱ到Ⅲ期的患者，是指肿瘤已经侵犯到肌层和外膜，而晚期就相当于Ⅳ期患者，肿瘤有远处淋巴结转移或者远处转移，早期和中期适合手术治疗，而晚期就适合以放疗为主的综合治疗。但食管癌早期难以发现，超过90%的食管癌患者确诊时已进展至中晚期，总体5年生存率不足20%，亟需寻找更有效的方案尽早发现和治疗。 食管癌前疾病指与食管癌相关并有一定癌变率的良性疾病，包括慢性食管炎、巴雷特食管、食管白斑症、食管憩室、贲门失弛缓症、反流性食管炎、各种原因导致的食管良性狭窄等。癌前病变指已证实与食管癌发生密切相关的病理变化，食管鳞状上皮异型增生与鳞癌发生密切相关，属癌前病变。若长期性胃酸反流，尤其是巴雷特食管，即食管下段的鳞状上皮被柱状上皮覆盖，是高危的食管癌癌前病变，其转化为食管癌的风险增加了30-125倍。癌变的概率与是否伴有异型增生关系密切，不伴异型增生的巴雷特食管，癌变概念较低，伴有中到重度异型增生的癌变概率高。 对于巴雷特食管的治疗主要包括药物治疗、内镜治疗和手术治疗。抗酸是治疗反流症状的主要药物，在抑酸药物中，质子泵抑制剂（某某拉唑）优于H2受体拮抗剂（某某替丁）。促动力药、粘膜保护剂等对控制症状及治疗反流性食管炎有一定疗效。非甾体抗炎药物能减少患食管癌、尤其是腺癌的风险。一般认为只要发现早、治疗规范，病变是可以逆转的，经过规范的治疗，85％以上的巴雷特食管通过药物可治愈。对不伴异型增生的巴雷特食管，因其癌变的概率低，不提倡内镜治疗。伴有轻度异型增生者，癌变概率亦较低，可先行内镜随访，如果是已经出现的中到重度异型增生可以局部处理或切除。目前常采用的内镜治疗方法有：内镜下粘膜切除术、凝固术、消融术等。对已证实有癌变的巴雷特食管患者，原则上应手术治疗。另外，反流使用药物无法控制者可行手术治疗。 microRNA(miRNA)——是一种小的、高度保守的内源性非编码RNA分子，大约由21-25个核苷酸组成。通过对靶mRNA表达的负调控，抑制或降解mRNA，进而调控细胞发育、凋亡、增殖及分化等生命活动。研究表明50%以上的miRNA定位于肿瘤的相关基因组区域（包括杂合子缺失区、染色体扩增区以及脆性位点等），因此miRNA广泛与许多人类癌症的病因和临床结果相关。既往全基因组研究报道，miRNA在食管癌的发生、发展、侵袭和转移中发挥重要作用，其表达信号可用于癌症风险预测、早期诊断、组织学分类和预后评估。此外，miRNA还参与调节化疗敏感性，有可能成为治疗的新靶点，并可用于预测食管癌化疗疗效。 microRNA芯片属于微阵列芯片技术，利用分子杂交原理，使同时被比较的标本（用同位素或荧光素标记）与微阵列杂交，通过扫描杂交信号强度，计算该样品中miRNA的表达量，再经过数据统计和处理，可全面比较不同标本的基因表达水平的差异。 已有研究发现，miR-21、miR-155、miR-223、miR-375、miR-203、miR-133a、miR-451与多种肿瘤细胞的增殖、侵袭、血管的生成和耐药性等生物学行为相关。在食管癌细胞中，7种miRNA差异最为显著，其中miR-25和miR-130b与肿瘤组织的分化程度有关，miR-7、miR-25、miR-181d、miR-335和miR-495与食管癌的大体分型有关，miR-103、miR-107的上调与患者的生存期及预后密切相关。越来越多的研究对食管癌miRNA表达谱进行测定及分析，这对食管癌早期筛查及早期诊断有重要意义，同时为进一步研究食管癌的发生、发展机制提供依据。
目的及意义： 在本课题的研究中，我们将以高度异形增生巴雷特氏食管microRNA表达谱数据为研究对象，寻找高度异形增生巴雷特氏食管样本中差异表达的microRNA分子，并对其进行诊断力评价。进一步将microRNA标记物分子调控的靶基因映射到分子通路，力争发现新颖的高度异形增生巴雷特氏食管相关的分子信号通路，这些通路若经过进一步的实验验证，将为了解高度异形增生巴雷特氏食管分子机制提供重要的信息。 |
2. 研究内容和预期目标
研究内容：
在本课题的研究中，我们将以高度异形增生巴雷特氏食管microrna表达谱数据为研究对象，寻找高度异形增生巴雷特氏食管样本中差异表达的microrna分子，并对其进行诊断力评价。进一步将microrna标记物分子调控的靶基因映射到分子通路，力争发现新颖的高度异形增生巴雷特氏食管相关的分子信号通路，这些通路若经过进一步的实验验证，将为了解高度异形增生巴雷特氏食管分子机制提供重要的信息。需要对国内外高度异形增生巴雷特氏食管疾病标记的研究进展进行详细讨论，研究主体包括以下部分：
(1) microrna表达芯片数据的收集以及预处理；
3. 研究的方法与步骤
方法：
(一)根据论文题目，查阅相关文献。
包括正式出版的中外学术期刊和专著。从中选择10篇以上重点参考文献认真阅读，综合分析，写出文献综述，概括出最新研究进展与存在问题。在上述基础上，完成论文开题报告。
4. 参考文献
| [1] Xu, L., D. Geman, and R.L.Winslow, Large-scale integration of cancer microarray data identifies arobust common cancer signature. BMC Bioinformatics, 2007. 8: p. 275. [2] Cahan, P., et al.,Meta-analysis of microarray results: challenges, opportunities, andrecommendations for standardization. Gene, 2007. 401(1-2): p. 12-8. [3] Rhodes, D.R., et al.,Large-scale meta-analysis of cancer microarray data identifies commontranscriptional profiles of neoplastic transformation and progression. ProcNatl Acad Sci U S A, 2004. 101(25): p. 9309-14. [4] Fundel, K., et al.,Normalization strategies for mRNA expression data in cartilage research.Osteoarthritis Cartilage, 2008. 16(8): p. 947-55. [5] Rao, Y., et al., Acomparison of normalization techniques for microRNA microarray data. StatAppl Genet Mol Biol, 2008. 7(1): p. Article22. [6] Hua, Y.J., et al.,Comparison of normalization methods with microRNA microarray. Genomics, 2008.92(2): p. 122-8. [7] 杨艳,韦淑贞, 张闯等. 食管癌相关微RNA研究进展[J]. 肿瘤研究与临床, 2017. 29(2): 129-133. [8] 王光,陆业婷,石志来. microRNA-21预测食管癌放疗敏感性和预后的意义[J].中国细胞生物学学报, 2013,07(29): 1-7. [9] 余江流,凌志强,毛伟敏. 食管癌相关微小RNA研究进展[J].国际肿瘤学杂志, 2011,38(12): 920-922. [10] 吴波,杨鲸蓉,朱捷. MicroRNA与食管癌化疗关系的研究进展[J].中国医药导报, 2016,13(23): 930-934. [11] 江文洋,任杰,范国华等. microRNA和食管癌关系的研究进展[J].现代肿瘤医学, 2015,23(13): 1931-1934. [12] 蔡晓波, 李庆, 郭俊明. MicroRNA与食管癌的研究进展[J].中国细胞生物学学报, 2013,07(29): 1-7. |
5. 计划与进度安排
本论文的各阶段安排为：
1、2022-2022-1学期17-20周～2022-2022-2学期第2周(2022-12-25～2022-03-8)接受任务，按照指导教师要求查阅资料，撰写开题报告。
2、第3周～第4周（2022-03-11～2022-03-22）进行数据收集，熟悉相关程序软件，数据的的预处理等。
