急性淋巴细胞白血病相关microRNA-mRNA互作用网络的构建开题报告

1. 研究目的与意义

本课题研究的背景

急性淋巴细胞白血病（acute lymphoblastic leukemia，all）是一种具有侵袭性的白血病，源于b或t细胞祖细胞的恶性转化。患者骨髓和外周血中存在特征性的淋巴母细胞或淋巴细胞增多现象。这些细胞可在骨髓聚集并抑制正常造血功能，还可扩散到淋巴结、脾、肝、中枢神经系统和其他器官。我国急性淋巴细胞白血病的发病率约为0.67/10万，在环境污染相对较严重的地区，其发病率显著高于全国发病率。根据淋巴细胞的类型，all可分为急性b淋巴细胞白血病（b-all）和急性t淋巴细胞白血病（t-all），其中b-all占85％，t-all占15％。t- all是来源于不成熟t 淋巴细胞的高度侵袭性恶性肿瘤，当前的常规化疗虽可以治愈 80%的儿童患者，但成人患者的 5 年总生存（os）率只有40%左右。急性 b 淋巴细胞白血病是一种由b 淋巴细胞在血液或骨髓中异常增殖引起的恶性血液疾病，是急性淋巴细胞白血病最常见的类型；主要发生在儿童，成人中相对少见。

急性淋巴细胞白血病的症状和体征包括虚弱或疲劳；发热或盗汗；容易出现瘀伤或出血；呼吸急促；突然的体重减轻或厌食；骨头或关节疼痛；淋巴结肿大且无痛等。急性淋巴细胞白血病的病因及发病机制尚未完全明了，但可能与遗传及家族因素、环境因素和获得性基因改变等因素有关。急性淋巴细胞白血病的精确诊断需要借助细胞形态学、细胞化学染色、免疫表型、细胞遗传学和分子生物的方法。多药联合强化疗及骨髓移植很大程度上提高了儿童急性淋巴细胞白血病的治愈率，但仍有一部分all 患儿治疗失败。

2. 研究内容和预期目标

研究内容：

在本课题的研究中，我们将以急性淋巴细胞白血病microrna表达谱数据及其配对mrna表达谱为研究对象，寻找癌症样本中差异表达的microrna分子，并利用mrna表达谱对microrna候选标记物分子进一步优化，并对其进行诊断力评价。此外，我们还将进一步将microrna标记物分子调控的靶基因映射到分子通路，并利用cytoscape构建microrna-mrna分子调控网络，寻找急性淋巴细胞白血病中microrna调控的模块。

(1) 基因表达芯片数据的收集以及预处理；

3. 研究的方法与步骤

方法：

(一)根据论文题目，查阅相关文献。

包括正式出版的中外学术期刊和专著。从中选择20篇以上重点参考文献认真阅读，综合分析，写出文献综述，概括出最新研究进展与存在问题。在上述基础上，完成论文开题报告。

4. 参考文献

[1] xu, l., d. geman, and r.l. winslow, large-scale integration of cancer microarray data identifies a robust common cancer signature. bmc bioinformatics, 2007. 8: p. 275.

[2][2] cahan, p., et al., meta-analysis of microarray results: challenges, opportunities, and recommendations for standardization. gene, 2007. 401(1-2): p. 12-8.

[3][3] rhodes, d.r., et al., large-scale meta-analysis of cancer microarray data identifies common transcriptional profiles of neoplastic transformation and progression. proc natl acad sci u s a, 2004. 101(25): p. 9309-14.

5. 计划与进度安排

本论文的各阶段安排为：

1、2022-03-1～2022-03-09 接受任务，按照指导教师要求查阅资料，撰写开题报告。

2、2022-03-10～2022-03-23 进行数据收集，熟悉相关程序软件，数据的预处理等。