microRNA调控的肾透明细胞癌相关信号通路分析开题报告

 2022-03-18 21:16:19

1. 研究目的与意义

肾细胞癌(rcc)是成年最常见的肿瘤,恶性肿瘤约占3%,死亡率最高可达40%以上。肾细胞癌起源于近端肾小管的内层。肾透明细胞癌是肾细胞癌的组织学亚型,约占转移性肾细胞癌的80-85%,也是最常见的肾细胞癌亚型。约有5%-10%的肾细胞癌化疗和放射治疗效果不佳。手术切除仍然是目前最好的根治肾细胞癌的手段,但肾切除后仍有20-40%的患者会复发。

肾细胞癌的表型、病理以及临床过程均存在异质性,目前尚缺乏早期检测的生物标志物。基于上述原因,肾细胞癌发生和发展的分子和遗传机制以及新型诊断和预后生物标志物的鉴定成为目前研究热点。

近年来,mirna表达谱分析是研究肿瘤的分子特征最常用的方法。mirna是天然存在的一类短的非编码单链rna,在转录水平调节基因的表达,通过部分结合3非翻译区的同源序列,导致靶标mrna的翻译抑制或直接降解mrna。成熟的mirna长度约为18-25个核苷酸。mirna在不同生物中的调节机制是具有进化保守性。通过调制关键的细胞过程,如代谢、分裂、分化、发育和细胞凋亡,mirna能够同时双向调节癌基因和抑癌基因。mirna已被多次证实在发病机制中发挥重要作用。mirna参与了许多癌症,包括前列腺癌,肺癌,乳腺癌,结肠癌,肾细胞癌的发病机制。mirna表达谱可与多种肾细胞癌特定基因的改变相关联,一方面诱导癌基因的表达,同时抑制肿瘤抑制基因。mirna对肾细胞癌的调控是复杂的,涉及若干机制,例如突变,后生改变,染色体畸变等。

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2. 研究内容和预期目标

在本课题的研究中,我们将以肾透明细胞癌microRNA表达谱数据为研究对象,比较癌症样本和正常样本间microRNA表达的差异,并从microRNA调控的靶基因和通路两个水平上寻找肾透明细胞癌相关的分子特征标记。

通过本课题,力争发现新颖的肾透明细胞癌相关的分子信号通路,这些通路若经过进一步的实验验证,将为了解肾透明细胞癌症发展的分子机制提供重要的信息。

3. 研究的方法与步骤

(一)根据论文题目,查阅相关文献。

包括正式出版的中外学术期刊和专著。从中选择10篇以上重点参考文献认真阅读,综合分析,写出文献综述,概括出最新研究进展与存在问题。在上述基础上,完成论文开题报告。

(二)实验研究前期准备工作

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4. 参考文献

[1]xu,l.,d.geman,andr.l.winslow,large-scaleintegrationofcancermicroarraydataidentifiesarobustcommoncancersignature.bmcbioinformatics,2007.8:p.275.

[2]cahan,p.,etal.,meta-analysisofmicroarrayresults:challenges,opportunities,andrecommendationsforstandardization.gene,2007.401(1-2):p.12-8.

[3]rhodes,d.r.,etal.,large-scalemeta-analysisofcancermicroarraydataidentifiescommontranscriptionalprofilesofneoplastictransformationandprogression.procnatlacadsciusa,2004.101(25):p.9309-14.

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5. 计划与进度安排

1、2022-03-1~2022-03-09接受任务,按照指导教师要求查阅资料,撰写开题报告

2、2022-03-10~2022-03-23进行数据收集,熟悉相关程序软件,数据的的预处理等。

3、2022-03-24~2022-04-06不同统计方法寻找差异基因的效果比较;择优采用统计算法选出肾透明细胞癌中差异表达基因;

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