金针菇AMPK基因的克隆、沉默菌株构建及功能研究开题报告

 2022-01-21 21:02:28

全文总字数:4880字

1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)

本课题的意义、国内外研究概况、应用前景等(列出主要参考文献)

金针菇(Flammulina velutipes)是一种传统的食用菌,别名冬菇、朴蕈、绒毛柄金钱菌等。其盖滑,柄脆、味鲜,营养极其丰富,每百克鲜菇含水89.739克,蛋白质2.729克、脂肪0.139克、灰分 0.839克、糖5.459克、粗纤维1.7克,铁0.22毫克、钙0.097毫克、 磷1.48毫克、钠0.22毫克、镁0.3l毫克,钾3.7毫克、维生素Bl 0.29毫克、维生素B2 0.2l 毫克、维生素C 2.7毫克,其含有多糖、糖蛋白、蛋白聚精、火菇素、火菇毒素、倍半萜等多种生物活性物质。据测定,金针菇氨基酸的含量非常丰富,高于一般菇类,尤其是赖氨酸的含量特别高,具有很高的药用价值,在国际市场上被誉为“超级保健食品”。近年来,消费者对金针菇的需求与日俱增,如何进一步提高金针菇的产量和品质成为当前重要的研究方向。

AMPK,全称为Adenosine 5‘-monophosphate (AMP)-activated protein kinase。其为AMP依赖型蛋白激酶,在细胞中扮演能量状态传感器角色,是生物体内的能量调控开关,通过微调合成代谢和分解代谢途径来维持能量储存,它可以感知生物体内能量水平的降低,进而打开分解代谢来增加能量的生成,关闭合成代谢来减少能量的消耗。AMPK与多种信号通路均存在联系,如它可以抑制Tor来促进自噬、调控生物体内NADP 和NAD 等的稳态、调控线粒体的生成和功能、通过磷酸化ACC来调节脂质的代谢等。在酿酒酵母中与AMPK同源的为Snf1蛋白激酶(Snf1/AMPK家族中的一种),是在非发酵碳源生长时被发现的,对于酵母应对营养胁迫发挥重要作用,此外,有研究报道,在酵母中, Snf1蛋白激酶可以被离子胁迫、碱性pH、氧化胁迫等非营养胁迫所激活;在动物体内,线粒体呼吸链抑制剂也可以激活AMPK,这些研究表明,AMPK除了应对营养胁迫外,在非营养胁迫下也发挥一定的功能。

最近,朱旭东课题组发现AMPK同源基因组snf1参与小孢拟盘多毛孢的初级代谢、细胞壁合成以及对渗透压的感应,snf1的破坏延迟了气生菌丝的生长,降低了分生孢子的数量,同时pestalotiollide B不再产生,这说明Snf1是参与次级代谢的关键因子。

AMPK的主要功能有调节机体的能量代谢、维持能量的供求平衡、靶向治疗肿瘤等。并且SNFl/AMPK通道相关研究主要集中在酵母领域,较少涉及丝状真菌,特别在食用真菌领域,此通道研究更为稀少。因此本实验旨在初步探究对于金针菇AMPK 的功能以及AMPK对金针菇次级代谢的影响,拓宽我们对于 AMPK 在金针菇中功能的认识,进一步探寻如何提高金针菇的产量和品质。

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2. 研究的基本内容和问题

研究的目标、内容和拟解决的关键问题

研究目标

在用真菌金针菇中研究ampk 的功能以及ampk对金针菇次级代谢的影响,拓宽我们对于 ampk 在金针菇中功能的认识,

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3. 研究的方法与方案

研究方法、技术路线、实验方案及可行性分析

研究方法

利用human,skeletal muscle中AMPK、Saccharomycescerevisiae中Snf1、Oryzasativa中Snf1基因编码的氨基酸序列,在金针菇基因组数据库中进行tBLASTn发现了金针菇的AMPK同源序列(6150)。利用基因克隆技术克隆金针菇AMPK基因,通过实验室前期构建的沉默载体构建AMPK沉默载体,通过脂质体转化技术得到沉默菌株,测定菌丝生长数据及各种氨基酸含量。

技术路线

实验方案

1. 设计引物:用Primer5.0设计目的基因沉默片段的特异引物

AMPKi-F:ACTGGGTACCATCCCTTAGATCGCATAAC

AMPKi-R:ACTGACTAGTTGGAGACCGAGAGCCTGTG

2. PCR扩增目的片段

3. 制胶、跑胶:用凝胶电泳成像仪观察PCR之后的电泳条带,挑选出有条带的引物,完成第一轮筛选

4. 割胶回收

5. 碱裂解法提取质粒

6. 金针菇中硝酸还原酶基因沉默片段、沉默载体(PMI)的双酶切与回收:将酶切后的产物用琼脂糖凝胶电泳验证,并将酶切后的目的条带进行柱式DNA胶回收试剂盒回收

7. 将沉默基因片段与沉默载体片段进行酶连

8. 转化与送测

9. 原生质体制备

10.脂质体转化

11.RNA提取

12.qRT-PCR

13.测定菌丝的生长指标及赖氨酸、精氨酸含量,测定金针菇蛋白质

可行性分析:

在本实验室(应用真菌实验室)食用菌研究中已经积累了丰富的经验,实验

技术、方法成熟。实验室成功建立了基因的沉默技术及过表达技术,这些遗传操作手段为下一步研究基因的功能提供优良的前提。AMPK 的研究手段和方法

在动物及酵母中已经较为成熟,能为我们提供广阔的思路和成熟的技术方法。

本项目的研究计划已经划分,步骤详细切实可行,工作量适中,可以在一年内

完成课题,并完成结题报告。

4. 研究创新点

特色或创新之处

AMPK 在酵母以及哺乳动物中已经得到了较为广泛的研究, AMPK 在维持细胞以及整个生物体能量稳态方面拥有重要作用。已知在一些非营养胁迫下 AMPK 对酵母的新陈代谢有明显的影响,而在金针菇中尚未有此方面的研究。

此研究的开展可以了解一些在金针菇生产过程中易出现的问题对金针菇生产的影响大小,同时研究金针菇在AMPK被沉默的条件下其主要药用价值各种氨基酸含量是否会发生变化,同时将金针菇AMPK与代谢调节之间建立联系,为金针菇的栽培提供一定的借鉴和参考。

5. 研究计划与进展

研究计划及预期进展

2018年 8 月-2018 年 10 月:培养野生型金针菇菌株并进行前期基本的知识技术积累;

2018年 10 月-2018 年 12 月:筛选突变株,并完成ampk对金针菇菌丝的影响研究

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