1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)
1、研究意义
灵芝(ganoderma lucidum (leyss. ex. fr)karst)属于真菌界(mycota),真核真菌亚界(eukaryomycota),真菌门(eumycota),担子菌亚门(basidiomycotina),层菌纲(hymenomycetes),非褶菌目(aphyllophprates),灵芝菌科(ganodermataceae),灵芝属(ganoderma)[1]。灵芝是著名的大型药用真菌,在中国有十分悠久的应用历史。我国有灵芝属真菌20多种,包括赤芝、黄芝、紫芝、黑芝、薄盖灵芝、树舌等。
灵芝是中国传统的扶正固本、滋补强壮中药,《神农本草经》将其列为上品,有益肺气,益肝气,益脾气之功效。由于其特殊的药用价值,在现代药物研究中,灵芝有效成分的分析及药理作用研究已引起了国际上的关注,相关工作主要集中在三萜、多糖、一些蛋白质等药用活性成分上。三萜类化合物作为灵芝的主要药用成分之一,具有镇静、抗氧化、抗病毒、降血压和抗肿瘤等活性,其含量的高低是目前衡量灵芝质量的重要指标,三萜类物质是灵芝的次级代谢产物,通过甲羟戊酸途径合成[2]。通过研究对灵芝三萜合成起调控作用的基因,了解其机理,对提高灵芝药用成分含量无疑将大有帮助。
2. 研究的基本内容和问题
1、研究目标
获得hog1的沉默转化子,对其表型进行分析,了解hog1在灵芝的生长发育以及次生代谢中的功能。
2、内容
3. 研究的方法与方案
1、研究方法
(1)灵芝菌丝体提取RNA的方法
① 样品裂解:取灵芝菌丝50~100 mg置于研钵,加液氮快速研成粉末。在液氮完全挥发前,取10~20 mg移入已加入800L RNA iso plus的离心管中,立即剧烈振荡摇匀。
② 室温静置5 min,12000 rpm,4C,离心5 min。
③ 吸取上清移入新离心管中,加入1/5体积(140-150L)氯仿,剧烈振荡15s以混匀,室温放置5min,12000 rpm,4C,离心15 min,分为三层。
④ 将上层水相小心移至另一离心管,加入等体积异丙醇,颠倒混匀,室温放置10 min。
⑤ 12000 rpm,4C,离心10 min,小心弃上清。
⑥ 在离心管中加入600L 70%乙醇,轻轻颠倒离心管混匀片刻后,12000 rpm,4C,离心5 min,小心弃上清。
⑦ 室温静置干燥3 min左右(放冰盒上),加入30L无RNase的ddH2O溶解5min,1%琼脂糖凝胶电泳检测RNA质量。
(2)DNA回收方法:
① 1%琼脂糖凝胶电泳分离条带。
② 透析袋准备:剪长约3cm透析袋浸于ddH2O中,并煮沸数分钟,用夹子夹紧一端,装约200~300μL的ddH2O(基本填满)。
③ 电泳结束后,紫外下切下目的片段所在胶块装于透析袋,加适量ddH2O,用夹子夹紧另一端。
④ 将透析袋装于电泳槽内自阴极向阳极电泳10min,再反向电泳15s。
⑤ 电泳结束后,取1.5mL离心管,将袋内液体转移至管中,并再洗涤透析袋。
⑥ 加2倍体积无水乙醇、1/10体积3M NaAc (pH5.2) 于-20C沉淀30min,12000 rpm离心5min,弃上清,吸干,100μL 75%乙醇洗涤沉淀,12000 rpm离心3min,弃上清,37℃晾干,沉淀溶解于适量ddH2O中。
(3)灵芝原生质体电击转化
① 碱裂解法制备质粒。
① 收取28℃静置培养(间或摇匀,约半天摇一次)三天半的灵芝菌丝,6000rpm,9min去除培养基。
② 0.6M甘露醇洗涤两次,每次6000rpm,10min。将洗涤后的菌丝移入10ml的离心管中,6000rpm,9min,去除残余的甘露醇。
④ 依每300mg湿菌丝加1ml 2%酶液,30℃酶解2h,并间或摇匀(30min摇一次)。
⑤ 5000rpm,10min,去除酶液,用电击缓冲液洗涤两次,每次4000rpm,8min。
⑥ 按电转样品数加入相应的电击缓冲液,重悬。
⑦ 加入质粒DNA(每200μL体系加1μg DNA)。
⑧ 把上述混合物置于冰上冰浴10min,进行电击(电击条件为:2.5kV/cm, 25μF, 400欧姆),电击后再冰浴10min。
⑨ 把上一步处理的菌液加入的5ml的上层CYM(含有50mg/L kan和100mg/L hyg)培养基中,混匀,平铺于下层CYM培养基。28℃再生培养7-10 天。
⑩ 将转化子挑取到PDA平板上进行5次传代培养,然后再回接到含有100mg/L hyg抗性PDA平板,仍能够生长的为初步得到的转化子。
挑取再生的转化子于含有150ug/ml潮霉素(hyg)的CYM平板上进行抗性筛选,待生长约10天后,选取潮霉素抗性较好的转化子于CYM平板上生长约一周,然后打孔接种于100ml CYM液体培养基中培养灵芝液体种子,28℃ 150rpm摇床培养7天,然后在超净台上用种子粉碎器粉碎,接种于100ml CYM液体培养基中,每瓶接种4-5ml液体种子,28℃ 150rpm摇床培养7天,收取菌丝进行RNA提取或60℃烘干,检测三萜含量。
(4)灵芝三萜含量测定
采用分光光度法测量胞内灵芝三萜含量:① 样品制备:精确称取烘干样品0.5g/0.2g,用95%乙醇浸泡样品,定容至25ml/10ml,超声波破壁2h,每20min摇一次,吸取1ml,4000rmp离心10min,取400μl上清备用② 空白制备:准确吸取100μl95%乙醇于干燥的10ml试管中③ 样品制定:准确吸取100μl上清于干燥的10ml试管中,加香草醛(香兰素0.5g 冰醋酸10ml溶解,现配现用)200μl,高氯酸500μl,混匀,呈棕黄色,于60℃水浴中保温20min,溶液呈黑色。取出后迅速用冰水冷却10min,再加5ml冰醋酸混匀,于550nm测吸光值。
2、技术路线
其他真菌中Hog 1序列 |
灵芝中Hog1 cDNA和蛋白序列 |
提取RNA,反转录得到cDNA |
扩增沉默片段,构建Hog1的沉默载体 |
电击转化灵芝G20菌株原生质体 |
挑取潮霉素抗性转化子 |
荧光定量PCR筛选Hog1沉默转化子 |
表型分析(分叉、耐受性、生长速度等) |
次生代谢产物的测定(三萜含量) |
生物信息学分析 |
同源性分析 |
功能域分析 |
进化树分析 |
3、实验方案及可行性分析
(1)实验室已经有实验的大部分实验设备
(2)实验室已经建立的灵芝的电击转化体系
(3)实验室建立了对灵芝重要的次生代谢产物灵芝三萜含量的测定
4. 研究创新点
Hog 1基因在其他真菌中已经有过很多的研究,但是在大型担子真菌中的功能还未见报道,研究了Hog1-MAPK 途径在灵芝中的作用,会更清楚的从分子生物学的角度了解灵芝,为更好地了解灵芝的一些途径搭建平台,提高相关次生代谢产物的合成如灵芝三萜等,提高了灵芝的有效代谢产物的产量、食用与药用价值。
5. 研究计划与进展
研究计划
1、2013.12-2014.2 查阅资料,整理实验思路,学习实验的基本方法
2、2014.2-2014.3 构建灵芝的hog1的沉默载体
