1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）
一、本课题的意义、国内外研究概况、应用前景
1.1选题依据及国内外研究动态
皮考啉酸（又名2-吡啶甲酸）是吡啶甲酸的2-位取代同分异构体，也是重要的有机合成中间体，在生产和生活中具有广泛应用。吡啶类农药由于其更高的生物活性、更高的选择性等特点而得到迅速的发展，因此作为吡啶衍生物的皮考啉酸在农药领域的应用将越来越广。同时,皮考啉酸是生物体内色氨酸代谢及硝基苯和2-氨基苯酚的微生物降解副产物；环境中煤油和骨油中的2-甲基吡啶的氧化,除草剂毒莠定、敌草快等的光降解过程也都是皮考啉酸的来源。由于皮考啉酸具有生物毒性,其应用和来源的广泛性使其在环境中逐渐积累,对生态系统和人体健康产生威胁。微生物降解环境中的皮考啉酸具有高效、安全的优点。
2. 研究的基本内容和问题
二、研究的目标、内容和拟解决的关键问题
在敲除调节基因r的基础上，以pic c为对象，研究其关键氨基酸在alcaligenes faecalis jq135分解代谢皮考啉酸中的作用。
以pic c为对象，研究其关键氨基酸在alcaligenes faecalis jq135分解代谢皮考啉酸中的作用时，对于基因组表达载体的构建以及外源表达需要着重完成。alcaligenes faecalis jq135分解代谢皮考啉酸具有24小时的延滞期，在实验的进程中可能对一些实验数据有影响
3. 研究的方法与方案
三、研究方法、技术路线、实验方案及可行性分析
3.1研究方法及实验方案
3.1.1转录结构分析
4. 研究创新点
野生菌降解皮考啉酸需要24小时的延滞期，在敲除picR基因的突变体中，降解阻遏解除，成为组成型表达，只有4小时的延滞期。以PicR为对象，研究其关键氨基酸的对阻遏调控的影响，通过一系列的实验，将Alcaligenes faecalis JQ135分解代谢皮考啉酸的代谢途径研究的更加透彻。
5. 研究计划与进展
2019年9月-2020年1月：查阅各种相关文献，设计实验方案，完成文献综述；开始实验前期准备工作。
2020年1月-2020年5月：完成开题报告和中期报告；提取野生型和敲除型的总rna，反转录为cdna，完成转录结构分析和荧光定量pcr，构建pet-picr表达载体，设计引物，完成picr与启动子的结合位点以及关键碱基。最后确定picr的效应物。
2020年5月-2020年7月：整理实验数据，撰写论文，准备论文答辩。
