猪HOXA11基因启动子区SNP检测及其与肉质性状关联分析开题报告

1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）

一、课题的意义

随着人们生活水平的提高，猪肉品质改良成为养猪业的一个重要目标。hoxa11基因属于同源异型盒基因家族，其功能主要与动物生殖系统发育、附肢和肌肉发育有关。目前对于hoxa11基因的研究多在生殖系统和肢体发育调控方面，对于其在肌肉发育相关的作用及其调控机制研究尚少。本课题拟挖掘hoxa11基因启动子区与猪肉质性状关联的snp，可以反映出该基因在肌肉发育中起到的作用，为肌肉发育调控机制的研究奠定基础，为猪肉品质改良提供分子标记。

2. 研究的基本内容和问题

一、研究目标

本研究对猪hoxa11基因启动子区域的snp进行鉴定，并与肉质性状进行关联分析，为肉质性状改良提供理论基础

3. 研究的方法与方案

一、研究方法

1. 通过ncbi获取hoxa11启动子区域序列，设计引物测序筛选snp

2. 等位基因特异性pcr（as-pcr）方法检测snp

4. 研究创新点

对HOXA11基因在肉质性状方面的作用的研究目前尚少，本课题选取HOXA11基因的启动子区域进行SNP检测，与猪肉质性状进行关联分析，可以为猪的肉质改良提供分子标记，为后续对该基因在肌肉发育调控方面的研究提供数据资料。

5. 研究计划与进展

2018年9月 查阅文献资料、准备实验材料

2019年3月 样品的pcr扩增，测序

2019年3月 筛选hoxa11基因启动子序列snp