茄子SmNSP2的生物信息学分析与miR171b表达载体的构建开题报告

 2022-02-07 20:46:21

1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)

1课题来源及选题依据(国内外研究动态、研究目的、意义)

1.1课题来源

本课题是南京农业大学生命科学学院生物化学与分子生物学实验室杨清教授课题组自选课题。

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2. 研究的基本内容和问题

研究目标在实验室前期工作中发现, miRNA171b受黄萎病诱导表达,降解组测序发现miRNA171b对黄萎病菌侵染具有强烈的响应,本研究将采用生理生化和分子生物学方法,获得miR171b基因的过表达及反义抑制植株。

研究内容
1)miR171b前体克隆;2)miR171b前体的表达模式分析;3)miR171b前体过表达与反义抑制载体的构建;4)miR171b转基因植株的构建与分子鉴定

3. 研究的方法与方案

实验流程3 试验设计(研究材料、方法和手段)3.1研究材料植物材料:茄子(solanum melongena l.)品种“苏琦一号”,种子购自江苏省农科院,为当地普遍种植品种。

菌株:大肠杆菌( escheriehia coli ) dh5α ;农杆菌gv3101(本实验室保存)载体:pcambia1304,pcambia1305(本实验室保存)。

3.2研究方法3.2.1 mir171b前体基因的克隆由于mirnabase里没有茄子相关的mirna,所以只能用其他亲缘较近的物种的mirna前体与茄子mirna做同源比对,并用rnafold对前体做茎环结构分析,从而获得茄子的mir171b前体。

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4. 研究创新点

创新之处获得miR171b前体及其过表达及反义抑制转基因株系;

5. 研究计划与进展

研究计划① 2019年9月-11月 与指导老师交流沟通,确定正确的研究思路,明确目前研究的不足之处,通过各种途径学习与本研究相关的知识以解决研究过程中将遇到的问题。

拟定具体的研究方案,并打印成表,以便严格按照计划实验。

向老师请教并确定研究过程中所需的材料和相应的仪器设备以及相关所需掌握的实验技术,并且通过实验课及书本熟悉仪器的原理和基本操作方法,为研究做好充足准备。

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