1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)
磷脂酶(phospholipase)通过水解磷脂产生不同的代谢产物,可以调节膜脂组分、分子种和不饱和度,来实现细胞膜的不同功能。根据水解甘油磷脂的位置不同,磷脂酶分为pla1(phospholipase a1)、pla2、plc(phospholipase c)和pld(phospholipase d)。根据水解底物专一性的不同,plc分为pi-plc (phosphoinositides-specific plc)和 npc (nonspecific phospholipase c,或者phosphatidylcholine-plc)(nakamura et al., 2005;nakamura, 2014)。其中,人们对动植物中pi-plc的生化特征、蛋白功能和信号传导等研究较为清楚;pi-plc水解pip2(phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate),产生ip3和dag, 二者调控下游信号转导和细胞应答(munnik, 2014)。植物 npcs 如何应答外界刺激并调控细胞应答,及其可能的分子机理,却知之较少。
拟南芥基因组编码npc蛋白有6个基因,分别命名为npc1-6。与 pi-plc 相比,npc 蛋白具有不同的生化特征。譬如,npc并不水解pip2,而偏好以pc、pe和lysopa 等脂类为底物(nakamura et al., 2005);其活性不依赖于钙离子(peterset al., 2010; reddy et al.,2010)。这表明,npc可能参与调控与pi-plc截然不同的信号过程和生物功能。在组织表达水平,拟南芥npc3和npc4在根尖强烈表达,npc5在花器官表达量较高;npc2和npc6在荚果表达量高,npc1在各组织均有较高表(peters et al., 2010)。在亚细胞定位水平,npc3和npc4位于细胞质膜;npc5主要存在于靠近叶绿体的胞质,其可能参与磷脂在内质网和叶绿体的转运过程(nakamura et al., 2005;gaude et al.,2008);其他三个npc3的亚细胞定位尚不清楚。已有研究表明,npc蛋白参与调控植物应答盐害和干旱、油菜素内酯信号和根发育等生物过程。其中,npc4参与植物应答盐和aba信号途径的调节。拟南芥npc4突变体在种子萌发、根发育和气孔运动等方面均表现为aba不敏感,而对水分、盐胁迫为敏感表型。
生长素参与植物生长、发育和逆境响应等重要过程(adamowski and friml, 2015; strader andzhao, 2016)。与其他植物激素相比,生长素具有相对特殊的生物合成、代谢平衡、极性运输和信号转导途径(feraru and friml, 2008)。生长素的跨细胞转运需要质膜定位的输出和输入载体蛋白,主要分为三种类型:生长素输入蛋白 aux1/laxs(auxin-resistant1/aux1-likes),生长素输出蛋白pins(pin-formeds )和abcb/pgp蛋白(atp-binding-cassette b/p-glycoprotein)(grunewald and friml, 2010)。其中,大部分pins蛋白在质膜极性分布,该特征决定了生长素的极性运输方向、分布(feraru and friml, 2008)。拟南芥基因组有8个基因编码 pin 蛋白,分布于不同的根细胞。pin1蛋白主要在根中柱细胞表达;pin2蛋白在根表皮层和皮层细胞表达较高;pin4蛋白在根柱细胞表达较强;pin7主要在中柱和根柱细胞表达(feraru and friml,2008)。另一方面,pins蛋白极性分布、活性受其磷酸化水平所调控(michniewicz etal., 2007)。pp2a磷酸酶和agcviii激酶家族的d6pk(d6 protein kinase)和pid/wag(pinoid/wag)激酶均参与pins蛋白的可逆磷酸化(michniewicz et al., 2007; huang et al., 2010; galvan-ampudia et al.,2013; haga et al., 2014; zourelidou et al., 2014)。
2. 研究的基本内容和问题
围绕“明确npc应答高铵胁迫的分子机理” 这一目标,本项目从npc脂酶活性、pins转运活性和生长素极性分布等方面,从生理生化、细胞和分子遗传等方面深入揭示npc与pins互作模式及其分子机制;利用蛋白截断表达、蛋白点突变技术,探寻 npc结合pin4的关键位点,并揭示该位点对其转运生长素活性和植物耐盐的影响。
拟解决的关键问题:实验过程中,转基因等手段获得纯合体材料,需要多次筛选鉴定,这一过程周期比较长,比较繁琐;互作蛋白筛选时,筛选效率低,找不到预想蛋白,需要多次筛选,工作量大,周期长。
3. 研究的方法与方案
本实验以野生型拟南芥;npc3/4/5遗传材料;npc缺陷突变体拟南芥;npc3/4/5基因双突变和三突变体、启动子-gus和mcherry标记蛋白的转基因材料;突变体回补材料;野生型过表达拟南芥为材料。
1. npc3/4/5遗传材料的获得、盐处理表型分析。
4. 研究创新点
近年来随着科研的不断深入,人们对NPC的研究越来越多,对其功能了解也越来越清楚,发现NPC在调节植物的生长发育、应对生物和非生物胁迫及信号转导过程中有着重要的作用。通过研究发现,在铵盐胁迫下,植物可以通过对体内的生长素进行重新分配,从而使植物避开铵盐胁迫,而且也发现这与PIN2蛋白有关,但具体的信号传导过程还不够明确。
本项目通过分子、细胞和遗传等方面综合研究,在研究思路、研究技术、实验材料和人员设备配备上能确保深入阐述NPC调控生长信号转导和应答高铵胁迫的分子机理,揭示一条脂信号的PINs转运和生长素极性分布的植物耐盐调控网络。
5. 研究计划与进展
2020年2月-2020年3月:设计实验方案并准备好实验相关材料
2020年4月-2020年5月:利用基于crispr/cas9的多基因编辑技术构建npc3/4/5基因单突变、双突变和三突变载体,筛选出侵染纯合体进行盐处理,表型观察,并进行数据统计,探究其作用机理;运用bifc来验证npc3/4/5与pin4互作。
