1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)
1.microrna研究背景
microrna(mirna)在动植物生物中普遍存在,是由22个核苷酸组成的小单链非编码rna分子,在真核基因表达的过程中起着重要的作用,同时也在很多生理学和病理学中扮演着重要的角色。其通过与目标mrna序列的3’非翻译区(3’utr)结合,降解靶mrna或抑制其翻译,在转录后水平调控基因表达,是许多生理学和病理学过程的主要参与者[1]。最早发现的mirna是lee等在线虫中发现的,即lin-4,研究发现,lin-4通过负调节lin-14蛋白的水平,从而导致lin-14蛋白从第一个幼虫阶段(l1)开始随时间下降[2]。研究者们逐渐意识到mirna在基因表达监管中扮演着重要的角色,越来越多的人开始研究其的特点和功能。
2. 研究的基本内容和问题
1.研究目标
此次实验旨在发现、确认mir-122的靶基因cs、dlat、gnpda1,并对其进行功能鉴定。鉴于mir-122在肝功能和肝脏病理学中的重要作用,通过对mir-122与靶基因进一步研究,揭示cs、dlat、gnpda1三个mir-122的靶基因在能量代谢、细胞增殖以及迁移中的作用机制。
3. 研究的方法与方案
1.研究方法及实验方案
1.1.使用mirna靶基因预测软件,即targetscan、pictar和miranda,预测靶基因。经过双荧光素酶报告基因法筛选出mir-122与肝脏细胞相关的预测靶基因20个,在293t细胞中分别进行转染:分别转入mir-122模拟物,nc,采用lip-2000转染试剂,转染48h后收样,通过qpcr进行定量分析,确定所筛选靶基因的受抑制程度;
1.2.然后,利用western blotting对总蛋白中靶基因编码蛋白的量进行鉴定分析,通过与正常细胞的western blotting结果做对比,进一步确认筛选的靶基因是否为mir-122的靶基因。
4. 研究创新点
近几年,随着生命科学领域的发展,对miRNA的研究已经成为一个热点。miRNA在体内分布范围广泛,参与的生物学过程繁多,生物功能复杂,因此研究miRNA靶基因的鉴定,对确定其生物学功能有着重要的意义。miR-122是肝脏高表达miRNA,在肝脏的生长发育、脂质代谢和肝脏疾病等方面起着重要的作用,鉴定miR-122靶基因,并对这些靶基因进行功能鉴定,有助于揭示miR-122在肝脏的生理学、病理学等过程中的调控机制,从而更进一步地为研究与肝脏相关的疾病奠定基础。
但是miRNA靶基因的鉴定仍存在困难,由于miRNA长度限制,以及与靶mRNA的不完全结合,故对于miRNA靶基因预测及鉴定的计算机预测、生物学实验方法等仍在不断地优化和完善,旨在可以使研究者们更有针对性地、更准确地研究目标miRNA,更加准确方便地阐明其在生命活动中的功能与意义。5. 研究计划与进展
1.研究计划
2019.10~2019.11构建预测靶基因的报告基因文库;
2019.11~2019.12mrna水平以及蛋白水平验证所筛选的预测的靶基因;
