红豆杉紫杉醇合成途径GGPPS和TS基因序列与时空表达分析开题报告

 2022-02-08 20:10:39

1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)

本课题的意义、国内外研究概况、应用前景等(列出主要参考文献)1、课题意义紫杉醇属于二萜类物质,具有高效抗癌特性。

一直以来,紫杉醇的生产是应用上的瓶颈,治愈一位癌症前期的病人需要两到四株成年红豆杉才能获得足够量的紫杉醇。

为了解决这一问题,国内外学者在人工栽培、紫杉醇化学半合成与全合成、内生真菌、细胞培养等领域进行了探索,并取得了一些进展。

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2. 研究的基本内容和问题

1、研究目标拟采用分子生物学方法,分析在南方红豆杉以及南方红豆杉变种中ggpps和ts两种基因的时空表达量,揭示ggpps和ts在红豆杉紫杉醇合成途径中的表达模式,为深入研究紫杉醇的生物合成和代谢调控奠定基础。

2、研究内容(1)南方红豆杉与南方红豆杉变种金锡杉中关键酶基因ggpps的时空表达分析1)南方红豆杉及其变种金锡杉的不同组织部位中关键酶基因ggpps的表达量分析分别采取南方红豆杉及其变种金锡杉的树叶、树皮、树枝和果实作为样品,运用引物设计、rna 提取、cdna 反转录以及半定量pcr的方法,分析两种红豆杉植株的不同组织部位中关键酶基因ggpps的表达量,揭示其在红豆杉紫杉醇合成途径中的表达模式。

2)南方红豆杉及其变种金锡杉在不同季节时其关键酶基因ggpps的表达量分析分别采取春季和夏季的南方红豆杉及其变种金锡杉的树叶作为样品,运用引物设计、rna 提取、cdna 反转录以及半定量pcr的方法,分析不同季节中两种红豆杉植株中关键酶基因ggpps的表达量,揭示其在红豆杉紫杉醇合成途径中的表达模式。

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3. 研究的方法与方案

研究方法、技术路线、实验方案及可行性分析1、研究方法与实验方案采用半定量pcr方法分析ggpps和ts两种关键酶基因在南方红豆杉与其变种金锡杉中的时空表达量,方法如下: (1)rna提取在1.5ml微量离心管中收集组织,并用一对镊子浸入液氮中冷冻,用一次性杵研磨,将100mg的冷冻组织转移到新的1.5ml微量离心管中,立即向其中加入500ul rcl buffer,以最大的速度进行涡旋混合,然后进行55度水浴1-3分钟,然后室温下离心机10000g离心5分钟。

将澄清的裂解物直接转移到2ml收集管中的gdna过滤柱中,并在室温下以14000g 离心2分钟。

用1倍体积rcb缓冲液过柱,最大速度涡旋20秒。

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4. 研究创新点

特色或创新之处本实验首次使用了南方红豆杉的变种金锡杉作为研究对象,与南方红豆杉原种相比,其紫杉醇含量明显较高,更加具有研究价值。

实验中所涉及的两种关键酶基因GGPPS 和TS的全长序列虽然已经被克隆出来,但是其表达模式尚未完全发现,因此本实验在此基础上,运用半定量PCR的方法来分析两种关键酶基因GGPPS 和TS的时空表达量,从而揭示两种酶基因在红豆杉植株中的表达模式。

5. 研究计划与进展

1、研究计划(1)2017年10月-2017年11月阅读大量文献从而确立相应的研究方法,并采集实验所需的南方红豆杉及其变种作为样品。

(2)2017年11月-2018年3月 运用引物设计、rna 提取、cdna 反转录以及半定量pcr的方法,分析关键酶基因ggpps的时空表达量,并确定其在红豆杉植株中的表达模式。

(3)2018年3月-2018年4月 运用引物设计、rna 提取、cdna 反转录以及半定量pcr的方法,分析关键酶基因ts的时空表达量,并确定其在红豆杉植株中的表达模式。

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