以小鼠(Mus musculus)为模型分析miRNA表达量与转录的相关性开题报告

 2022-02-08 08:02

1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)

1 本课题研究意义

1.1 背景和研究现状

1.1.1 microrna(mirna)简介

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2. 研究的基本内容和问题

2 本课题研究目标

2.1 研究目标

研究在基因组水平上调控小鼠mirna表达的机制,主要分析转录对体内mirna差异性表达的影响,藉此揭示新的基因调控机理。

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3. 研究的方法与方案

3 研究方法

3.1研究方法

根据本实验室以前的研究结果,drosha的相对特异性与mirna表达水平呈约0.5的正相关[13],说明还有其它机理起作用,因为理论上∑相关性2=1。现有数据表明转录对mirna表达的影响在人的细胞系中不一致[8]。然而转录被普遍认为是基因表达(如蛋白质表达)的首要因素,由于样品数量也有限,所以转录的功能值得更深入、更全面的研究。为此,本研究将采用已有的方法[8]对大量的高通量数据进行再分析。

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4. 研究创新点

本课题巧妙地利用现有数据,进行大量的生物信息学研究,将最彻底、最明确地回答一个长期被忽略、悬而未却的问题:在基因组层次上基因转录对miRNA差异性表达到底起多大的作用?

5. 研究计划与进展

2016.7-2017.1:前期准备,查阅文献及资料

2017.1-2017.3:下载、整理、格式化数据

2017.3-2017.5:相关性分析,整理结果

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