来源于Delftia sp.T3-6的多功能酰胺水解酶DamH的表达纯化与结晶开题报告

 2022-01-22 23:21:32

1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)

1.本课题研究意义氯代酰胺类除草剂作为一类高效的除草剂,在全球范围内广泛应用,研究表明大部分氯代酰胺类除草剂在环境中比较稳定,不易降解,使用后在土壤中和水域中残留,由此引起环境问题。

本实验材料选取了一株能高效水解cmepa的菌株delftia sp.t3-6。

本课题拟通过蛋白结晶的方法解析来源于delftia sp.t3-6的多功能酰胺水解酶damh的三维结构,将有助于揭示damh的底物选择性及多功能的催化机制,为酰胺类除草剂污染的治理提供应用基础。

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2. 研究的基本内容和问题

2.1 研究目标通过对来源于delftia sp.t3-6的多功能酰胺水解酶damh表达纯化与结晶,优化结晶条件,得到其三维结构,从而为阐明其催化机制提供基础。

2.2 研究内容(1)异源表达和纯化delftia sp.t3-6的多功能酰胺水解酶damh。

(2)蛋白质结晶试剂盒进行damh结晶条件的初筛。

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3. 研究的方法与方案

1. 实验方案1.1 蛋白的诱导表达将构建的表达菌株在lb固体平板画线活化,接种单菌落于5ml液体lb培养基,37℃过夜振荡培养作为种子液。

取4ml种子液转接于400ml液体lb培养基,37℃,180rpm培养至od600为0.6左右,加入1m iptg 20μl,18℃,180rpm培养24h,5,000rpm离心15min收集菌体,超声波破碎后,12,000rpm离心20min,蛋白质电泳,经考马斯亮蓝染色、脱色后观察结果。

1.2 蛋白的纯化与检测将破碎离心后的粗酶液过镍柱进行亲和层析,分别用0.05m,0.1m,0.2m,0.3m的咪唑洗脱,用1.5ml离心管收集各个梯度的洗脱液,经过蛋白质电泳,考马斯亮蓝染色后收集不含杂蛋白的收集液,合并后进行透析24h。

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4. 研究创新点

特色或创新之处来源于Delftia sp.T3-6的多功能酰胺水解酶DamH具有高效降解酰胺类除草剂的能力,而在降解酰胺类除草剂方面的研究还很少,通过解析该酶的三维结构,有利于揭示酰胺类降解反应的分子机制,并为环境治理提供应用基础。

5. 研究计划与进展

研究计划及预期进展2018年3月-2018年4月:蛋白的表达、纯化,蛋白结晶初筛;2018年4月-2018年5月:蛋白质结晶条件的优化,衍射数据采集;2017年5月:总结实验,分析数据,撰写论文

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