菌株Ensifer sp. 22-1中CnpR介导2,6-二氯-4-硝基苯酚降解的调控机制开题报告

 2022-01-26 11:26:52

1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)

1.课题来源、研究目的及意义:目前关于微生物脱氯降解氯代硝基苯酚(cnps)的研究报道很少。

本课题是基于从菌株22-1中克隆到的降解2,6-二氯-4-硝基苯酚(2,6-dc-4-np)的关键酶基因cnpr而进行研究的。

cnpr能参与调控将2,6-dc-4-np降解脱氯转化的过程。

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2. 研究的基本内容和问题

主要研究内容: 1、2,6-二氯-4-硝基苯酚降解基因簇中转录单元的鉴定前期的研究表明2,6-二氯-4-硝基苯酚降解基因cnpabcde在基因组上分布在一起,组成基因簇。

通过cdna 5端快速扩增技术(5-race),拟测定该降解基因簇的转录起始位点, 通过反转录pcr检测的方法确定基因簇中的转录单元。

2、2,6-二氯-4-硝基苯酚降解调控基因cnpr的功能鉴定在菌株22-1降解2,6-二氯-4-硝基苯酚(dcnp)的基因簇中克隆到一个lysr家族的调控基因cnpr。

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3. 研究的方法与方案

1.实验材料菌株22-1,来自于本实验室前期筛选的。

2.实验方案:(1)cnpr基因的功能验证通过对cnpr基因的敲除和互补来确定其功能 首先将cnpr基因在原始菌株22-1中敲除(利用阴性菌接合转移型质粒和sacb反向筛选标记进行基因插入失活或删除),获得cnpr缺陷型菌株。

然后借助广宿主载体pbbr1mcs-5将cnpr基因互补至缺陷型菌株中,获得cnpr缺陷互补株。

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4. 研究创新点

特色与创新之处:阐明菌株22-1中CnpR调控2,6-二氯-4-硝基苯酚降解的分子机制,探讨微生物对污染物的降解利用以及对环境污染的适应机制。

5. 研究计划与进展

1.研究计划: 2015.4-2015.7 1.cnpr基因的敲除和互补,并比较突变株、互补株和野生株降解性状的差异,确定降解基因簇中转录调控蛋白cnpr的功能; 2.重组表达并且纯化cnpr。

2015.8-2015.12 1.研究cnpr的调控信号分子; 2.研究cnpr与启动子结合的精确位点以及转录单元的确定,阐明cnpr调控降解基因(cnpabc)转录的分子机制。

2016.1-2016.6 1.数据整理分析,并撰写论文。

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