土壤微生物元蛋白质组学特性研究开题报告

1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）

土壤是一个复杂的动态系统，土壤中时刻发生着物理、化学、生物组分的相互作用。

微生物是地球环境的重要组成成份，对现今环境条件的塑造起到了主要作用。

它们是生物地理化学的主要驱动者，在营养循环、污染物的降解等方面发挥着重要的作用。

2. 研究的基本内容和问题

土壤中微生物类群丰富多样，研究稻田土壤不同微生物的剖面分布、固氮微生物类群分布，有助于从蛋白质水平上阐明稻田土壤微生物功能和代谢。

实验选择南方免耕稻田为典型研究区域，以固氮微生物类群为研究对象，采用15n稳定同位素标记技术，示踪土壤中的微生物氮固定过程，明确土壤微生物蛋白之间的相互作用。

采用protein-sip 技术，揭示微生物氮固定过程。

3. 研究的方法与方案

土壤蛋白提取实验方法：（参照karuna chourey法）1） 称取5g过2mm筛的新鲜土，用10%的pvpp清洗样品，于液氮中研磨。

2） 将土样置于50ml的离心管中，加入10ml碱性sds缓冲液中。

3） 涡旋2-3min，沸水浴10min。

4. 研究创新点

以核酸为基础的微生物多样性研究并不能完全体现微生物群落机构与功能的关系，元蛋白质组学能够提供群落微生物蛋白和功能多样性间的信息，以揭示微生物群落结构在蛋白质水平上的差异。

5. 研究计划与进展

2014.10--2014.11 设计实验，购买实验仪器、试剂。

2014.11--2014.12 土壤样品采集，预处理。

2014.12-2015.01 土壤总蛋白提取，分离。