1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)
鳃耳肾综合征(branchiootorenal syndrome,bor)是一种常染色体显性混乱引起的综合征,主要表现为弓形鳃裂、囊肿,双边耳坑,听力损伤以及肾畸形等。
鳃裂瘘管占儿童头颈部疾病的32%~45%,有这种疾病的儿童同时出现听力损伤或者耳聋,或者家族里有耳聋的亲属很有可能是bor综合征。
正常人口中40000人中有1人即为鳃耳肾综合征,在耳聋的小孩中有2%能被确诊为bor综合征。
2. 研究的基本内容和问题
研究的目标:寻找bor综合征致病基因未知的突变位点,进行进一步的研究探索。
研究的内容:从医院搜集到三个bor家系的外周血样本,对外周血进行dna抽提。
查阅文献后找出已报道的致病基因,对外周血dna中eya1、six1、six5基因所有外显子进行,测序验证,找到突变位点,研究突变位点对基因的影响。
3. 研究的方法与方案
(1)利用dna抽提试剂盒完成样本的基因组dna抽提,并测定其浓度值;(2)通过ncbi,ucsc和ensembl软件查找已知的致病基因,看文献查找是否有突变热点,用primer3网站进行引物设计;(3)用sanger测序法对病人基因组dna中的目的基因进行扩增,琼脂糖凝胶电泳对核酸进行测定。
纯化后测序;(4)分析测序结果,将测序结果进行比对,寻找突变位点;(5)若发现有未知的突变位点,进行进一步的探究探索。
可行性分析:由于本实验的试验方法比较成熟,所以测序过程应该会比较顺利。
4. 研究创新点
创新点:有筛查到未知突变位点的可能
5. 研究计划与进展
1、计划:(1)20142学习实验室基本技术,查阅有关课题的文献,寻找已报道的致病基因(2)20143设计引物,目的基因测序,寻找突变位点(3)20144筛选突变位点,进行功能性研究(4)20145数据分析,论文撰写。
预期进展:找到相关的突变位点进行分析研究。
