1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)
崇明拟异小杆线虫(heterhabditidoides chongmingensis)是指导教师课题组发现鉴定的昆虫病原线虫新种,是带有共生菌专性的昆虫病原寄生线虫。
sir2(silence infmation regulat)是一种烟酰腺嘌呤二核苷酸(nad )依赖型的组蛋白/非组蛋白去乙酰基化酶,广泛存在于从古细菌到哺乳动物中的多种动物中,具有高度保守的催化结构域[1]。
不仅是重要的能量状态传感器,还在细胞抗胁迫方面发挥不可替代的作用,调控细胞以及生命体在饮食限制过环境胁迫条件下的生命进程[2-3]。
2. 研究的基本内容和问题
1.研究目标研究sir基因在不同崇明拟异小杆线虫处理组中的差异表达,并寻找延长线虫寿命方法;2.研究内容为了解sir基因在线虫新种崇明拟异小杆线虫中的表达情况以及其与线虫共生菌之间的共生关系,进一步阐释sir-2.1的作用机理,开发昆虫病原线虫及其共生细菌资源,本次建立了4种线虫细菌共生体系。
提取4种不同细菌共生体系线虫组的rna,反转录后选取9322(sir)基因做实时定量qrt-pcr验证。
3.拟解决的关键问题获得扩增效果好、纯度高的目的基因片段;
3. 研究的方法与方案
1.研究方法利用非变性琼脂糖凝胶电泳检测rna,验证所提取rna是否为目的基因rna;①称取0.5g琼脂糖粉末,加入放有36.5ml的depc水的锥形瓶中,加热使琼脂糖完全溶解。
稍冷却后加入5ml的10x电泳缓冲液、8.5ml的甲醛。
然后在胶槽中灌制凝胶,插好梳子,水平放置待凝固后使用。
4. 研究创新点
1.着眼于近年来备受关注的的长寿基因sir-2.1及刚刚发现的昆虫病原线虫新属,崇明拟异小杆线虫,在研究材料上实现了突破;2.通过改变sir-2.1基因的表达寻找昆虫病原线虫的长寿方法,为低成本大规模生产和培育效果更好的线虫生物防护产品提供了可能;3.采用RNA干扰法构建sir-2.1缺失型昆虫病原线虫,此为该实验方法在昆虫病原线虫上的首例使用。
5. 研究计划与进展
2015.12-2016.01培养昆虫病原线虫,提取线虫RNA2016.01-2016.02设计引物,反转录cDNA,通过凝胶电泳和荧光定量鉴定出扩增纯度好含量高的目的基因2016.02-2016.03通过将目的基因移入表达载体,构建sir-2.1缺失型线虫2016.03-2016.04对缺失型病原线虫和野生型病原线虫做对照试验,记录其表型变化,生活周期,寿命等生理指标之间的差异,整理试验结果,编写论文。
