番茄抗坏血酸过氧化物酶2基因的克隆及生物信息学分析开题报告

1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）

本课题意义：番茄在分类上属于茄科（solanacea）番茄属（lycopersicon esculentum mill.）植物，属中度盐敏感型鲜食和加工型蔬菜作物，喜光耐热，易受到低温、弱光、土壤盐渍化等逆境的影响。

有研究表明，低温弱光下番茄幼苗的生长量、叶片叶绿素含量、光合速率会下降，盐胁迫和根际低温明显抑制番茄地上部和地下部的生长，膜脂过氧化增强，造成了氧化损伤，严重地影响番茄的生长发育，导致产量和品质降低。

因此，探讨番茄的apx与抗逆性的关系以及apx 在氧化胁迫中基因的表达调控具有重要的理论意义和实践价值。

2. 研究的基本内容和问题

研究目标：探究apx-2基因的克隆方法和生物学信息。

内容：对apx-2基因进行克隆，对该产物进行测序，利用生物信息学手段进行分析。

拟解决的关键问题：得到测序正确的产物。

3. 研究的方法与方案

研究方法：实验法，文献研究法，跨学科研究法，信息研究方法。

技术路线：引物设计-提取番茄总rna-rtpcr-cdna文库-dna片段-构建克隆载体-产物测序-生物信息学分析。

实验方案：1.从番茄基因组中提取目的基因2.从大肠杆菌中提取t载体及pet28载体3.对目的基因、t载体进行双酶切获取带有活性端的基因片段。

4. 研究创新点

1.生物信息学分析。

2.运用番茄基因组测序成果。

3.本实验采用定量pcr检测生长素和β-cdh诱导番茄侧根过程中apx-2基因转录水平的变化。

5. 研究计划与进展

研究计划：第1周：以论文题目为核心，对相关资料进行收集和翻阅。

对已搜集的资料加以整理。

第2-8周：将实验前半部分原核表达部分做完。