基于比较基因组的柳树Motif的发现与注释开题报告

1. 研究目的与意义

在几乎所有基因的上游区域中都还存在着激活基因所需的一段特定的dna序列，即转录因子结合位点。

这些特定的dna序列也被称为转录调控元件，又称模体（motif）。

motif本身并不执行任何具体的功能，只有当其被调控蛋白（转录因子）识别、结合后才能发挥应有的作用，它们共同控制着基因的转录。

2. 国内外研究现状分析

发达国家非常重视生物信息学方面的研究，大力支持生物信息学的发展，很多科研机构如雨后春笋般成立起来。

早在1988年的11月，美国国家生物技术信息中心（national center for biotechnology information，简称ncbi）就由美国国立医学图书馆建立起来，主要目的是建立起公共可接入数据库，以此来引导针对生物信息以及基因(组)数据分析的软件的开发，截止到目前，美国国家生物技术信息中心已经成为了世界顶级的生物信息数据中心，其开发的如pubmed、protein、genbank等数据库为生物信息的分析提供了方便[2][3]。

1993年3月，欧洲生物信息研究所（embl-european bioinformatics institute，简称embl-ebi）成立，它是由欧洲分子生物学研究室建立的，作为一个非营利性的学术机构，ebi主要从事生物信息学方面的研究[4]。

3. 研究的基本内容与计划

1 完成开提报告和文献综述 1周2 阅读文献 2周3 初步研习相关算法 2周4 设计算法、分析数据 7周5 得出结果 1周6 撰写毕业论文 2周7 毕业答辩 1周

4. 研究创新点

杨树和拟南芥的基因组数据相对完备，但是柳树的基因组数据中还有很多信息没有被挖掘。

本设计主要通过比较基因组的方法，对发掘簸箕柳中可能的模体（Motif）进行了研究，最终发现了可能的Motif，并画出了相关的图形。