1. 研究目的与意义
马尾松是多年生常绿树种，在创造经济价值和发挥生态效应方面占据着举足轻重的地位。为提高马尾松遗传改良工作效率，人们通过利用分子标记技术来推进其改良进程。简单重复序列（SSR）是分子标记的一种，它分布于整个基因组，具有高度重复性和可靠性，多态性好并且易于操作等优点。本实验利用生物信息学相关软件（Phrap，Primer等）从最新测得的部分马尾松EST序列中开发SSR引物，并对开发的SSR引物进行筛选，筛选出的具有多态性SSR引物可用于马尾松遗传连锁图谱构建，种质资源遗传多样性研究，物种间的通用性比较等，为进一步分子实验做好准备，也为从分子标记辅助选择育种角度提高马尾松改良效率提供帮助。
2. 国内外研究现状分析
国内：
李丹等（2000）采用rapd技术分析测定了3个马尾松海拔梯度种群的分子遗传特征。申响保（2005）利用马尾松嫩叶为材料，从99条随机引物中筛选出具有多态性的5条引物，对来自湖南省桂阳马尾松实生种子园的23个f1子代进行了rapd扩增反应，利用spss对数据进行了处理，把23个f1代进行了聚类，建立了系统聚类图。尹佟明等(1997)利用300个随机寡核坩酸引物和马尾松种子的胚乳(大配子体)产生的随机扩增多态性dna(rapd)分子标记，进行马尾松遗传连锁图谱的构建。赵阿风（2005）从松属其它物种中筛选出8对具有较高多态性的引物。
国外：
3. 研究的基本内容与计划
为提高马尾松遗传改良工作效率，本次实验利用生物信息学相关软件从马尾松est序列中开发ssr引物，并对开发的ssr引物进行筛选，筛选出的引物可用于遗传图谱构建，种质资源遗传多样性研究，物种间的通用性比较等，为进一步分子实验做好准备，也为分子标记辅助选择育种角度提高马尾松改良效率提供帮助。
计划：
2011.11.102012.1.14完成论文基础资料收集及开题报告。
4. 研究创新点
马尾松是重要的用材树种，在国内外均引起了很大的重视。近几年来，SSR分子标记作为一种共显性标记利用越来越广，如果从马尾松基因组DNA中开发获得SSR引物，所需成本高，且操作繁琐。本实验利用生物信息学相关软件根据最新测得的部分马尾松EST序列开发EST-SSR引物并对引物进行筛选，筛选出适合马尾松的具有多态性的SSR分子标记，不仅可以降低研究成本，提高实验效率，又能为以后马尾松遗传连锁图谱构建，遗传多样性分析等研究提供帮助。
