玉米YTH基因家族的生物信息学分析任务书

1. 毕业设计（论文）的内容和要求

1. 掌握植物基因家族成员的鉴定、进化分析、保守序列和基因表达分析等方法。

2. 鉴定出玉米基因组中的YTH基因，明确其进化历史与机制、基因表达模式、蛋白质互作情况等。

2. 实验内容和要求

1.玉米中yth基因的系统鉴定。通过关键词搜索、blast比对等手段鉴定出玉米中yth家族所有成员；

2. 基因复制和系统发育分析。通过分析yth基因的复制事件和系统发育关系，明确该家族的进化历史与机制；

3. 基因表达分析。通过检索ncbi est数据库获得基因表达信息，明确玉米yth基因在不同组织器官中的表达情况。

3. 参考文献

[1] 李大勇. 水稻抗病相关rna解旋酶基因osbirh1的功能分析及yth蛋白基因家族的初步研究[d], 2007, 浙江大学.

[2] zhang z, theler d, kaminskam, etal.the yth domain is a novel rna binding domain [j]. j.biol.chem., 2010,285(19): 14701-14710.

[3] imai y, matsuo n，ogawa s，et al. cloning of a gene，yt521，for a novel rnasplicing-related protein induced by hypoxia/reoxygenation [j].mol.brain res.,1998,53(12): 33-40．

4. 毕业设计（论文）计划

2022年11月-2022年12月，查阅相关文献，熟悉各种生物信息学数据库和软件；

2022年1月-2022年3月，完善技术路线，开展各种分析；

2022年4月-2022年5月，分析和整理实验结果，撰写论文。