玉米BURP基因家族的生物信息学分析任务书

 2023-08-22 08:53:06

1. 毕业设计(论文)的内容和要求

1.掌握植物基因家族成员的鉴定、系统发育和表达分析方法。 2.鉴定出玉米BURP基因,明确其进化历史与机制,及在不同组织器官中的表达情况。

2. 实验内容和要求

1. 玉米burp基因的系统鉴定。

通过关键词搜索、blast比对等手段鉴定出玉米burp家族所有成员; 2. 基因复制事件和系统发育分析。

通过分析zmburp家族的基因复制事件和系统发育关系,明确该家族的进化历史与机制;3. 基因表达模式分析。

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3. 参考文献

[1] Hattori J, Boutilier K A, Lookeren Campagne M. M, et al. A conserved BURP domain defines a novel group of plant proteins with unusual primary structures[J]. Mol. Genet. Genom., 1998, 259(4): 424-428[2] Boutilier K A, DeMoor J M, Huang B, et al. Expression of the BnmNAP subfamily of napin genes coincides with the induction of Brassica microspore embryogenesis[J]. Plant Mol. Biol., 1994, 26(6): 1711-1723[3] Held B M, Wang H Q, Colbert J T, et al. Zrp2: a novel maize gene whose mRNA accumulates in the root cortex and mature stems[J]. Plant Mol. Biol., 1997 ,35(3): 367~375

4. 毕业设计(论文)计划

2022年11月-2022年12月,查阅相关文献,熟悉各种生物信息学数据库和软件; 2022年1月-2022年3月,完善技术路线,开展各种分析; 2022年4月-2022年5月,分析和整理实验结果,撰写论文

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