糖类化合物与CAZy酶的虚拟对接研究文献综述

 2022-12-04 04:12

开题报告内容:(包括拟研究或解决的问题、采用的研究手段及文献综述,不少于2000字)

一:研究背景

碳水化合物亦称糖类化合物,是自然界存在最多、分布最广的一类重要有机化合物,是一切生物体维持生命活动所需能量的主要来源。在自然界中,糖类分子构型多样,糖分子之间化学键有多种类型,几乎所有生物大分子(糖分子、蛋白质、脂质和核酸等)都可以被糖基化。 机体内糖的代谢途径主要有葡萄糖的无氧酵解、有氧氧化、磷酸戊糖途径、糖醛酸途径、多元醇途径、糖原合成与糖原分解、糖异生以及其他己糖代谢等。

碳水化合物活性酶是一类重要的活性蛋白,分为糖苷水解酶类、糖基转移酶类、多糖裂解酶类以及糖酯酶类,其作用是降解、修饰以及生成糖苷键。

在宏基因组学快速发展之下,CAZy酶的研究和应用显得越来越重要。随着计算机运算能力的提升,高通量筛选和酶与靶点的虚拟对接被引入到研究中,其产生的数据库也成为了基因组学与酶学研究的重要桥梁。

二:研究目的

(1)通过大通量的运算筛选和基于分子动力学的计算机模拟,研究出CAZy酶与糖分子的虚拟对接方式;

(2)了解CAZy酶的作用机制,提高蛋白质工程设计和计算机辅助药物设计的成功率;

(3)了解CAZy酶与糖代谢相关的知识。

三:研究方法

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