1. 研究目的与意义
食管癌（esophageal carcinoma ）是由食管鳞状上皮或腺上皮的异常增生而形成的恶性病变。食管癌在中国是一种较为常见的消化道恶性肿瘤，近年来发病率呈逐渐上升趋势。其亚型包括腺癌（eac）和鳞状细胞癌（esophageal squamous cell carcinoma,escc），每个亚型都有特定的细胞起源、发病机制和流行病学，其中食管鳞癌是主要的组织亚型。
食管癌的发生是一个涉及多因素、多步骤、多阶段、多基因变异积累和相互作用的复杂过程。目前已知可能引起食管癌的因素有（1）食管其他病变诱发；（2）长期食用亚硝胺类化合物（腌制品如酸菜、豆酱等）；（3）食管癌高发地区水中的微量元素（钼、铜、铁、锌等）缺乏；（4）饮食习惯不注意如长时间食用粗糙质硬食物或辣椒等刺激性食物，进食过热过快，大量吸烟酗酒等；而家庭饮食习惯使食管癌具有明显的家族聚集现象，可能会出现连续三代或三代以上的患病家族。
食管癌早期症状常不明显，诊断是通常已到晚期，导致预后不良。尽管在手术、放疗和化疗等多种技术方面取得了新的进展，但食管癌患者5年生存率仅约20.9%。若能在早期获得诊断，则患者5年生存率将会显著提高。因此，找出合适的食管癌早期诊断方法或挖掘食管癌早期临床诊断标志物对食管癌的治疗有深远的的影响。
2. 研究内容和预期目标
对国内外食管癌疾病标记的研究进展进行详细讨论，研究主体包括以下部分：
(1) 基因表达芯片数据的收集以及预处理；
(2) 不同统计方法寻找差异microrna的效果比较；
3. 研究的方法与步骤
1. 检索各大基因表达谱数据库如arrayexpress（http://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/）和gene expression omnibus(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)，食管癌microrna表达芯片数据及其配对的基因表达芯片数据。
2. 整理芯片信息，选取食管癌样本和正常样本进行对照的芯片信息，进行下一步分析。
3. 采用多种差异基因表达分析软件，包括most，ort，copa，os等，分别针对芯片数据寻找出在癌症样本中差异表达的microrna。
4. 参考文献
1. 郑志范, 苏华芳, 邹燕,等. microrna在食管癌放射抵抗细胞表达谱研究[j]. 中华医学杂志, 2011, 91(9):639-642.
5. 计划与进度安排
1、2022-2022-1学期17-20周～2022-2022-2学期第1周～第4周(2022-12-25～2022-03-23)接受任务，按照指导教师要求查阅资料，撰写开题报告。
2、第1周～第4周（2022-03-15～2022-03-28） 进行数据收集，熟悉相关程序软件，数据的的预处理等。
3、第5周～第8周（2022-03-26～2022-04-20） 不同统计方法寻找差异microrna的效果比较；择优采用统计算法选出疾病中差异表达microrna；
