开题报告内容:
- 课题的研究背景、意义和目的
蛋白质磷酸化是生物体内一种非常重要的蛋白质翻译后修饰方式。磷酸化与去磷酸化是可逆的双向调节过程,通过这一过程,生物体可以控制自身的细胞通讯、信号传导等多种重要的生命活动,而不正常的磷酸化会使生命活动产生紊乱,与多种疾病的发生密切相关。蛋白质组学以生物体全部蛋白及其活动规律为研究对象,是后基因组时代生命科学研究的核心内容。确定磷酸化蛋白质的修饰位点是磷酸化蛋白质组学研究的首要任务和关键步骤。然而由于磷酸化修饰是一种动态过程,且存在磷酸化蛋白丰度低、信号被非磷酸化肽段所掩盖等问题,限制了磷酸化蛋白质组学的发展。因此,亟需开发高效的富集策略,以提高检测灵敏度、富集特异性,增大富集容量。
本课题研究意在建立一套高效富集磷酸化肽段方案,进而拓展对磷酸化肽段的认识,并对磷酸化翻译后修饰的研究奠定基础。
- 课题研究的主要内容
全细胞裂解液的蛋白磷酸化水平以及磷酸化蛋白的分析。
- 研究手段
- 全细胞裂解液还原烷化、甲醇氯仿沉淀
- 酶切(LysC ,Trypsin)
- 脱盐、TiO2富集磷酸化肽段、脱盐
- BP-HRP 基于碱性环境下的疏水性反向层析、脱盐
- LC-MS/MS检测
- 进度安排
2020.3-2020.4 查阅课题相关文献,完成实验具体内容的确定、实验准备等工作。
2020.4-2020.5 完成实验工作。
2020.5-2020.6 补充整理数据,完成毕业论文的撰写、修改与校对等工作。
五、综述
磷酸化蛋白质组学富集策略进展
摘要:蛋白质的磷酸化是一种可逆性的翻译后修饰, 在细胞的增值、分化、信号转导以及转录与翻译调控、蛋白质复合体的形成、蛋白质降解等方面发挥着极为重要的作用。因此磷酸化蛋白的鉴定成为翻译后修饰研究的重要内容。然而,磷酸化蛋白丰度低、信号被非磷酸化肽段所掩盖等问题限制了磷酸化蛋白质组学的发展。因此,亟需开发高效的富集策略,如设计新型纳米材料,合并多种分析方法等,以提高检测灵敏度、富集特异性,增大富集容量。本文介绍磷酸化蛋白组学研究中应用较为广泛和最新建立的各种分离富集方法的原理、特点、应用研究进展。
