猪HOXA13基因SNP检测及其与肉质性状关联分析开题报告

1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）

1. 课题意义

猪肉是人们日常饮食中的蛋白质主要来源之一。而随着生活水平的提高，人们对口感好、风味佳等具有优良肉质性状的肉类的需求不断提高，因此推动了畜牧业育种工作对猪优质肉品系或品种的选育。而利用肉质性状关联的遗传标记进行选育，即标记辅助选育，能大大提高育种工作的效率和准确性，近年来在畜牧业中得到推广应用。但是，目前经过功能鉴定的肉质性状关联的分子遗传标记数量较少，有待进一步挖掘和鉴定。

2. 研究的基本内容和问题

1. 研究的目标

本研究鉴定猪hoxa13基因启动子区snp，预测snp位点可能存在的转录因子，并与肉质性状（如肉色和肌内脂肪等）进行关联性分析，旨在挖掘影响猪肉品质的基因，为猪肉质的育种改良奠定基础。

2. 研究内容

3. 研究的方法与方案

1. 研究方法

1.1.1 dna提取

采用酚-仿法提取dna。

4. 研究创新点

本试验选取快慢肌差异表达基因HOXA13，检测其启动子区域可能存在的SNP，进行基因分型并与肉质性状关联分析，为优良肉质猪种的选育提供分子标记和数据基础。

5. 研究计划与进展

研究计划：

2018年9月查阅文献资料、准备实验材料

2018年10月样品的pcr扩增，测序