1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）
课题意义：
起调控作用的rna在转录后水平的微调中起重要作用，它包括微小rna (microrna, mirna)和小干扰rna (small interfering rna, sirna)。其中由 mirna 介导生成的首尾相连，具有相位排列结构特征的植物内源 sirna 被证明具有调节作用，被称为相位短干扰rna（phasirna）[1]。已经证明它们在生殖发育和调节其反式靶标中起重要作用[2]。具体来说，由mir2118和mir2275分别触发的21nt和24nt的phasirna已被证明是玉米配子发生的关键调节因子[3]。由报道表明phasirna的调节作用与光周期敏感的基因pms1相关，可调节水稻光周期敏感的雄性不育[4]。mirna数量有限，但phasirna数量巨大，研究phasirna可以揭示在植物生长发育、生物和非生物胁迫中新的调控作用，拓宽转录后调控的机制，具有深远的生物学意义。
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2. 研究的基本内容和问题
研究目标：
识别和分析水稻lncrna来源的phasirna
研究内容：
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3. 研究的方法与方案
研究方法：
收集研究对象lncrna相关数据，在linux平台上利用python计算机语言，对数据进行整理、转换、筛选，进而找出phasirna，并对结果进行分析。
技术路线：
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4. 研究创新点
严格筛选lncRNA数据，建立含有物种信息、基因编号、initiat、cDNA注释、p-value、小RNA来源等的完善且可靠的phasiRNA数据库；部分phasiRNA的底物经过降解组的靶基因验证。
5. 研究计划与进展
2018.7-2018.11 收集数据，整理分析
2018.11-2019.2数据分析
2019.2-2019.5 撰写报告及论文
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