过氧化氢相关基因——oxyR的敲除及其生长曲线的测定开题报告

 2022-01-29 19:05:38

1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)

田菁茎瘤菌(azorhizobium caulinodansors571 )在与田菁建立的共生关系时,可同时形成根瘤和茎瘤。

茎瘤与根瘤相比有固氮酶活性高,固氮量大等优点,所以研究田菁茎瘤菌具有十分重要的意义。

而田菁茎瘤菌中的ros的相关研究却知之甚少。

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2. 研究的基本内容和问题

目标:通过本实验,检测在体外条件下H2O2相关基因katG以及oxyR的调控机制内容:(1)构建菌株Δ katG,ΔoxyR,Δ katG (pYC12- katG)和 ΔoxyR(pYC12- oxyR),WT(pVIK112-PkatG);(2)确定不影响WT生长的最高的H2O2工作浓度,进而检测katG基因在WT菌株和ΔoxyR中表达情况;同时,检测WT、Δ katG、 ΔoxyR,及缺失互补株的生长情况;拟解决的关键问题:各种重组载体,敲除菌株的构建,及检测条件的建立。

3. 研究的方法与方案

2. 拟采取的研究方法、技术路线、实验方案及可行性分析研究方法与实验方案:2.1Δkatg和Δoxyr敲除株的构建2.1.1katg overlapping pcr用clone manager 设计引物序列,以http://www.microbesonline.org/上ors571的基因组为模板,并根据需要加入克隆所需要的酶切位点和保护碱基,所用引物为azc3290-1(ecori),azc3290-2,azc3290-3,azc3290-4(xbai),其中azc3290-2和azc3290-3引物之间有26bp互补序列。

按照如下overlapping pcr程序扩增获得azc3290两端序列拼接片断。

pcr反应体系1(azc3290上游区域dna的扩增):10taq buffer (含mg2 ) 10 μldntp (各2.5mmol/l) 6 μlazc3290-1引物(10μmol/l) 2 μlazc3290-2引物(10μmol/l) 2 μlrtaq 0.4 μlprimestar 0.2 μl模板dna 1 μlddh2o 86.7 μlpcr反应条件:预变性95℃ 5min;变性94℃ 30 s,退火58℃ 30 s,延伸 72℃45 s(30个循环);72℃末端延伸10min。

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4. 研究创新点

田菁茎瘤菌(Azorhizobium caulinodans ORS571)中ROS的相关研究还知之甚少。

而本实验立足于ROS中的H2O2相关基因oxyR的调控机制的研究,具有十分重要的意义。

5. 研究计划与进展

1)成功获得Δ katG,ΔoxyR,Δ katG (pYC12- katG)和 ΔoxyR(pYC12- oxyR),WT(pVIK112-PkatG)菌株;(2)测定ΔoxyR相关基因的生长曲线

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