1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)
1.本课题的意义:总rna提取是紫背天葵相关分子生物学研究的重要基础,总rna的提取质量将直接影响后续的分子生物学实验研究,因此本实验诣在寻找一种总rna提取质量最优的提取方法。
2.国内外研究概况:紫背天葵(gynura bicolor(roxb.exwilld.)d.c)原产于中国,在南方多省均有分布和种植,具有药用和经济价值。
近年来,国内外学者关于紫背天葵的资源、栽培、化学成分、微量元素、营养与保健进行了较多的研究工作,并取得了一定的进展吗,但是对于分子生物学领域的研究目前较少。
2. 研究的基本内容和问题
1.目标:提取紫背天葵总RNA,达到理想的理化指标2.内容:以新鲜的或低温保存的紫背天葵叶片为实验材料,通过液氮研磨处理,再分别经过SDS法、CTAB法、Trizol法、异硫氰酸胍法这四种主要方法进行总RNA提取,获得的总RNA将进行浓度、纯度等理化指标测定,并通过电泳和紫外扫描进行检验,以此选择得到最优的提取方法并加以改良优化,确保最高效的提取质量最佳的总RNA3.拟解决:如何对比多种总RNA的提取方法进行试验,最终选择得到最优的提取方法
3. 研究的方法与方案
1.研究方法:先进行文献查阅,对于植物组织总rna提取方式进行归纳,再通过对比试验,选择提取紫背天葵总rna效率最高的实验方法2.技术路线:新鲜或-70 ℃保存的紫背天葵叶片液氮研磨分别采用sds法、ctab法、trizol法、异硫氰酸胍法提取总rna获得总rna浓度测定、电泳、紫外扫描通过理化分析选择最佳提取方法并改良优化3.实验方案:本研究主要采用sds法、ctab法、trizol法、异硫氰酸胍法sds法称取1.0 g新鲜或-70 ℃保存的紫背天葵叶片置于预冷的研钵中,加入少量 pvpp,加入液氮充分研磨成粉末状,转移至1.5 ml离心管中,加入 600 μl 提取液[0.1 mol /l tris-hcl( ph值9. 0),含 15 μl β-巯基乙醇]旋涡混匀,室温静置15 min; 加入 250 μl 20% sds 裂解液, 轻轻混匀, 室温静置5 min, 12 000 r /min 离心 10 min; 取上清, 加 入 1 /3 体积的8 mol /l licl,上下颠倒混匀后, 于 4 ℃ 冰浴 2~3 h; 4 ℃ ,15 000 r /min离心 20 min,取上清; 用500 μl sste 溶解沉淀,再加入等体积的酚-氯仿 (1∶1 ) 涡旋混匀,12 000 r /min 离心 10 min; 上清转移至新的 1.5 ml 离心管中,加入等体积的氯仿旋涡混匀,12 000 r /min离心10 min; 取上清, 加入等体积异丙醇,-20 ℃ 放置2 h; 4 ℃,12 000 r /min 离心20 min,得沉淀,用体积分数为 75% 乙醇洗涤,将沉淀在超净工作台无rnase 环境中干燥; 加入 50 μl depc 水,充分溶解沉淀。
ctab法称取 1 . 0 g 新鲜或 - 70 ℃ 保存的紫背天葵叶片置于预冷的研钵中 , 加入少量 pvpp, 加入液氮充分研磨成粉末状, 然后转入 2支 1 . 5 ml ep 管中 ; 加入 4 ml rna 提取液( 预先在 60 ℃ 水浴中保温 1 h) 和 80 μl β - 巯基乙醇并混匀; 加入等体积的氯仿 ∶ 异戊醇(24 ∶ 1 ) 混匀后 4 ℃ , 12 000 r /min 离心 10 min,将上清液转移到另一离心管中 , 重复抽提 1 次; 取上清液于另一支 1 . 5 ml 离心管中 , 加入 1 /4 体积的 10 mol /l licl 混匀,4 ℃ 沉淀过夜或 - 20 ℃ 沉淀 1 h; 4 ℃ 12 000 r /min 离 心20 min, 弃上清液, 将沉淀溶于60 ℃ 预热的 500 μl 纯化缓冲液中 , 60 ℃ 温浴 5 min, 加入等体积氯仿 - 异戊醇(24 ∶ 1 ) , 混匀; 4 ℃ 1 200 r /min 离心 10 min, 将上清液转移至 1 . 5 ml 的ep 管中 , 向上清液中加入等体积无水乙醇, - 20 ℃ 沉淀 1 h;4 ℃ 12 000 r /min 离心 10 min, 弃上清液, 用淀, 将沉淀在超净工作台无 rnase 环境中干燥; 加入 50 μldepc 水, 充分溶解沉淀 。
trizol法1. 0g 新鲜或 - 70 ℃ 保存的紫背天葵叶片置于预冷的研钵中 , 加入少量 pvpp, 加入液氮充分研磨成粉末状, 转入盛有 1 ml trizol 的 1 . 5 ml 离心管中 ( 分两管 ) , 振荡混匀, 室温放置5 min左右, 4 ℃ , 12 000 r /min 离心 10 min; 取上清, 用 ( 原 trizol 试剂 1 /5) 酸性酚和氯仿的 等体积混合物抽提, 混匀后,4 ℃ , 12 000 r /min 离心 10 min, 重复 1 遍, 再用氯仿抽提 1遍; 将上清液转入新的 1 . 5 ml 离心管中 , 加入异丙醇( 原 trizol 试剂 1 /2) , 混匀, 室温放置 15 ~ 30 min, 4 ℃ , 12 000 r /min离心 20 min, 得白色沉淀; 加入体积分数为 75% 的乙醇漂洗,将沉淀在超净工作台无 rnase 环境中干燥; 加入 50 μl depc水, 充分溶解沉淀异硫氰酸胍法称取 1 . 0 g 新鲜或 - 70 ℃ 保存的紫背天葵叶片置于预冷的研钵中 , 加入少量 pvpp, 加入液氮充分研磨成粉末状, 加入至装有 rna 提取液(4 ml 的 4 mol /l 异硫氰酸胍和150 μlβ - 巯基乙醇 ) 中旋涡混匀, 室温静置 10 min; 用等体积的酚 ∶ 氯仿(1 ∶ 1 ) 抽提 2 次, 每次于 4 ℃ , 12 000 r /min 离心10 min; 用 等 体 积 氯 仿 抽 提 1 次, 4 ℃ , 12 000 r /min 离 心10 min, 取上清; 加入 2 倍体积无水乙醇; - 20 ℃ 放置 60 min,沉淀 rna; 4 ℃ , 12 000 r /min 离心 10 min, 收 集 沉 淀 并 用75% 乙醇洗涤; 用 500 μl 无 rnase 水溶解沉淀, 加入等体积的氯仿旋涡混匀, 12 000 r /min 离心 20 min; 取上 清, 加 入1 /10 体积的 4 mol /l licl 和 2 倍体积的无水乙醇, - 20 ℃ 放置60 min; 4 ℃ , 12 000 r /min 离心 20min, 得沉淀用体积分数为 75% 乙醇洗涤, 将沉淀在超净工作台无 rnase 环境中干燥; 加入 50 μl depc4.可行性分析:目前国内外均成功进行过多种植物的总rna提取,其中一部分种类的植物的组织含有酚类、花青素等天然活性成分,针对这些植物有着相适应的总rna提取方法,紫背天葵叶片所含化学物质与这些种类的植物近似,这些提取方法对于本实验研究有着一定的参考价值,因此本实验也具有较高可行性。
4. 研究创新点
国内外对于多种植物都进行过总RNA提取,包括一些富含多酚多糖类物质的植物总ENA提取,紫背天葵叶片含有与其近似的化学成分,但对于其总RNA提取的研究,国内外目前进行地较少;本实验进行多种实验方法的选择、对比,着重于实验方法的改良优化
5. 研究计划与进展
1.研究计划:2014年12月 文献查阅及文献综述整理2015年2月至3月实验方法总结及准备工作2015年3月至4月 对于各种实验方法进行预实验,并对于实验结果进行分析2015年4月至5月 通过实验结果分析,选择最优实验方法,并在此基础上进行改进及优化,获得理想的理化指标2.预期进展:中期检查前完成对几种实验方案的对比,中期检查后完成对最佳实验方案的选择及优化
