齐墩果酸抗肿瘤靶点的分子对接研究开题报告

 2022-02-21 19:44:51

1. 研究目的与意义

齐墩果酸是从龙胆科植物獐牙菜属的青叶胆全草或女贞子的果实中分离提取得到的一种五环三萜类化合物,为广谱抗菌药,临床上用于治疗支气管炎、肺炎、急性扁桃体炎、泌尿系统感染等,此外还有保肝、降糖、抗hiv和抗肿瘤等药理作用。

药理作用:齐墩果酸是女贞子的主要有效成分,具有保肝、免疫调节、强心、降脂、抗炎、抗衰老、抗菌及抗病毒、降血糖、抗诱变、抗肿瘤及抗癌等作用。

炮制方法对齐墩果酸的影响:在女贞子炮制研究中,由于齐墩果酸等三萜类脂溶性成分为主要活性成分,所以炮制以酒蒸和酒炖方法应用居多。经不同方法炮制后齐墩果酸提取量有不同程度的增加,蒸制品和醋制品增加量最多,各炮制品中齐墩果酸的量都高于生品。

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2. 研究内容和预期目标

本研究要在查阅文献的基础上,通过基于受体三维结构的分子对接技术(molecular docking),探索齐墩果酸与肿瘤细胞凋亡相关蛋白的结合情况。通过autodock、pymol等软件计算齐墩果酸三维结构与特定蛋白受体之间的对接情况及结合能,确定齐墩果酸的作用靶点及氨基酸残基。

3. 研究的方法与步骤

研究方法:拟采用autodock预测齐墩果酸的潜在抗肿瘤靶点

步骤:

①结构预处理:应用chemdraw软件画出齐墩果酸分子结构,并用cherm3d进行能量优化;在蛋白质pdb晶体数据库中找寻蛋白受体的结构。对接模拟前,将所有配体从蛋白受体复合物中去除,加上极性氢原子及电荷。最后与齐墩果酸进行分子对接。

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4. 参考文献

[1] 刘亭亭,王萌.女贞子化学成分与药理作用研究进展[j].中国实验方剂学杂志,2014,20(14):228-234.

[2] 罗小民. 分子对接在药物设计中的应用[d]. 中国科学院上海药物研究所

[3] 胡翠英, 郭伟强, 藏帅, 顾华杰, 蒋伟娜, 王桃云. 利用autodock预测苍术酮的潜在抗肿瘤靶点[j]. 生物技术, 2014, 24(6): 60-63.

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5. 计划与进度安排

(1)2022-12-25~2022-3-18(第1-2周)查阅文献、设计方案、完成开题报告。

(2)2022-3-19~2022-6-10(第3-14周)完成分子对接工作,总结研究结果。

(3)2022-6-11~2022-6-22(第15-16周)撰写毕业论文并答辩。

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