水稻POP基因家族的生物信息学分析任务书

1. 毕业设计（论文）的内容和要求

1.掌握植物基因家族成员的鉴定、系统发育和表达分析方法。

2.鉴定出水稻基因组中的POP基因，明确其进化历史与机制，及在不同组织器官中的表达情况。

2. 实验内容和要求

1. 水稻pop基因的系统鉴定。通过关键词搜索、blast比对等手段鉴定出水稻pop家族所有成员；

2. 基因复制事件和系统发育分析。通过分析水稻pop家族的基因复制事件和系统发育关系，明确该家族的进化历史与机制；

3. 基因表达分析。通过est数据检索，明确pop基因在水稻不同组织器官中的表达模式。

3. 参考文献

[1] Venalainen J, Juvonen R, Mannisto P. Evolutionary relationships of the prolyl oligopeptidase family enzymes [J]. 2004,271:2705-2715.

[2]Polgr L. The prolyl oligopeptidase family [J]. Cell Mol Life Sci, 2002,59: 349362.

4. 毕业设计（论文）计划

2013年11月-2013年12月，查阅相关文献，熟悉各种生物信息学数据库和软件；

2022年1月-2022年3月，完善技术路线，开展各种分析；

2022年4月-2022年5月，分析和整理实验结果，撰写论文。