通过起始密码子靶向（SCoT）标记显示出药用杭白菊的遗传多样性和关系外文翻译资料

 2023-01-07 15:59:30

通过起始密码子靶向（SCoT）标记显示出药用杭白菊的遗传多样性和关系

原文作者:Shang-Guo Fenga，*，1，Ren-Feng Hea，1，Meng-Ying Jianga，Jiang-Jie Lua，Xiao-Xia Shenb，Jun-Jun Liuc，Zhi-An Wangb，*，Hui-Zhong Wanga，*

单位：a College of Life and Environmental Sciences， Zhejiang Provincial Key Laboratory for Genetic Improvement and Quality Control of Medicinal Plants，Hangzhou Normal University，Hangzhou 310018， China

B Institute of Chinese Meteria Medica， Hangzhou 310023， China

C Pacific Forestry Centre， Canadian Forest Service，Natural Resources Canada，Victoria V8Z 1M5， Canada

摘要：菊花是我国重要的商品药材，广泛应用于观赏园艺和传统医药中。本研究应用起始密码子靶向（SCoT）多态性标记对32种杭白菊的遗传关系进行了研究。三十二个SCoT引物共扩增出872个位点，其中90% （785）表现多态性。SCoT引物的平均多态性信息含量为0.987（0.950～0.993），表明中国杭白菊种间存在丰富的遗传多样性。SCoT标记聚类分析（基于UPGMA和PCoA方法）将杭白菊的所有品种分为两类。根据其起源和生态分布，树状图和PCoA样地的聚类划分相似，聚类程度大。本研究结果将为杭白菊种质资源保护提供参考，对完善现有的杭白菊育种工作具有一定的指导意义。结果表明，SCoT标记具有较高的信息价值，可用于评价中国药用杭白菊品种的遗传多样性。

关键词：菊花； 遗传多样性； SCoT 标记

  1. 介绍

菊花，菊花属植物菊科多年生草本植物。它不仅是世界上最受欢迎的观赏植物之一，也是我国受欢迎的传统药用植物之一。由于其富含黄酮类和其他生物活性物质，对人体健康具有重要的药理作用，对风热感冒、头痛头晕有显著疗效。国内药用菊花的主要品种按产地和炮制方法可分为“杭菊”、“柏菊”、“贡菊”、“滁菊”、“淮菊”、“川菊”、“鸡菊”和“杞菊”。中国主要的生产中心是江苏省盐城、安徽滁州和色县、河南五指。

在各种药用栽培种植地区，一些种群的遗传多样性退化是由于连续无性繁殖。此外，由于城市化的发展，一些种群的数量已经大大减少。利用DNA分子技术了解药用药用杭白菊植物资源之间的遗传关系，将有助于育种工作者将杭白菊植物种质资源用于育种计划。近年来，利用RAPD、ISSR、SRAP、ITS和叶绿体trnL-F序列等分子标记系统对杭白菊遗传亲缘关系进行了评价。

近年来，起始密码子靶向多态性作为一种基于翻译起始密码子的新型、简单、可靠的基因靶向标记系统被开发出来，用于SCoT标记分析的引物来自翻译起始密码子ATG的保守区。SCoT标记技术作为一种新型的分子标记方法，已成功地在水稻、花生、芒果、马铃薯、葡萄、麻疯树和石蒜上应用。为了更好地利用和保护药用药用栝山的遗传资源，本研究对药用药用杭白菊品种的遗传多样性和亲缘关系进行了SCoT分析。

  1. 材料和方法
    1. 植物材料

我们试图收集尽可能多的药用杭白菊种质资源。共采集了32个居群，包括24个品种的样本。标本取自中国主要分布区;采样的种质和凭证标本如表1所示。利用中国科学院植物研究所植物标本室标本对这些品种进行了鉴定。凭证样品保存在杭州师范大学浙江省药用植物遗传改良与质量控制重点实验室。

表1

Original accession

Code

Longitude （E）

Latitude （N）

Location

Voucher numbers

Hangju lsquo;Dayangjursquo;

Dyj-1

120◦32

30◦38

Tongxiang， Zhejiang province

CM1

Hangju lsquo;Dayangjursquo;

Dyj-12

120◦43

29◦05

Panrsquo;an， Zhejiang province

CM12

Hangju lsquo;Dayangjursquo;

Dyj-21

115◦03

31◦18

Macheng， Hubei province

CM21

Hangju lsquo;Zaoxiaoyangjursquo;

Zxyj-2

120◦32

30◦38

Tongxiang， Zhejiang province

CM2

Hangju lsquo;Zaoxiaoyangjursquo;

Zxyj-13

120◦43

29◦05

Panrsquo;an， Zhejiang province

CM13

Hangju lsquo;Xiaoyangjursquo;

Xyj-3

120◦32

30◦38

Tongxiang， Zhejiang province

CM3

Hangju lsquo;Xiaoyangjursquo;

Xyj-20

115◦03

31◦18

Macheng， Hubei province

CM20

Hangju lsquo;Yizhongdabaijursquo;

Yzdbj

120◦32

30◦38

Tongxiang， Zhejiang province

CM4

Hangju lsquo;Xiaohuangjursquo;

Xhj-5

120◦32

30◦38

Tongxiang， Zhejiang province

CM5

Hangju lsquo;Xiaohuangjursquo;

Xhj-10

120◦43

29◦05

Panrsquo;an， Zhejiang province

CM10

Hangju lsquo;No. 1 of Jinjursquo;

Jj1

120◦32

30◦38

Tongxiang， Zhejiang province

CM6

Hangju lsquo;No. 2 of Jinjursquo;

Jj2-7

120◦32

30◦38

Tongxiang， Zhejiang province

CM7

Hangju lsquo;No. 2 of Jinjursquo;

Jj2-14

120◦43

29◦05

Panrsquo;an， Zhejiang province

CM14

Hangju lsquo;No. 3 of Jinjursquo;

Jj3

120◦32

30◦38

Tongxiang， Zhejiang province

CM8

Hangju lsquo;No. 4 of Jinjursquo;

Jj4

120◦32

30◦38

Tongxiang， Zhejiang province

CM9

Hangju lsquo;Chidahuangjursquo;

Cdhj

120◦43

29◦05

Panrsquo;an， Zhejiang province

CM11

Hangju lsquo;Dabaijursquo;

Dbj

120◦25

33◦78

Sheyang， Jiangsu province

CM15

Hangju lsquo;Xiaobaijursquo;

Xbj

120◦25

33◦78

Sheyang， Jiangsu province

CM16

Hangju lsquo;Changbanjursquo;

Cbj

120◦25

33◦78

Sheyang， Jiangsu province

CM17

Hangju lsquo;Hongxinjursquo;

Hxj

120◦25

33◦78

Sheyang， Jiangsu province

CM18

Hangju lsquo;Dahuangjursquo;

Dhj

120◦25

33◦78

Sheyang， Jiangsu province

CM19

Machengju

Mcj

115◦03

31◦18

Macheng， Hubei province

CM22

Boju lsquo;Dabojursquo;

Dboj

115◦78

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