DRAMP数据库及网络分析平台的研究文献综述

DRAMP数据库的管理及网络分析平台的维护

开题报告内容：（包括拟研究或解决的问题、采用的研究手段及文献综述，字数不少于1500字）

一、课题背景

随着微生物对抗生素的耐药性日益严重，寻找抗生素的替代品变的越来越重要。抗菌肽（AntimicrobialPeptides,AMPs）因具有独特的抗菌机制、广谱且不易产生耐药性等特点，为人们寻找理想的抗菌药物提供了新的方向，也为人类战胜耐药微生物带来了新的契机，现在是各科研单位、企业、公司等研究和开发的热点。

国外已有人认识到建立相关数据库并提供抗菌肽综合信息服务的重要性。一些抗菌肽数据库已在国外建立并投入服务，其中APD,PhytAMP,BACTIBASE,PenBase,CAMP,ANTIMIC,APPDb,AMSDb,SAPD等数据库都提供了很多抗菌肽的相关信息，并可以实现在线网页查询预测、分析的功能，能很好的服务科研人员。

但这些数据库中，大部分是专一型抗菌肽，如：PhyAMP数据库只包括植物来源的抗菌肽，BACTIBASE数据库只包含细菌来源的抗菌肽，PenBase的抗菌肽只来源于虾类，theDefensinknowledgebase和PeptailbolDatabase分别关于防御素和晶体素。这些数据库对特定类型的抗菌肽的查询很有用，但不能满足对抗菌肽整体数据的需求。在包含所有类型抗菌肽的数据库Antimic,AMPer，APD和CAMP中，只有APD和CAMP现在依然可以被访问，其他数据库都已停止服务。

截至到目前，国内还没有此类数据库和网站的研究开发项目。所以，开发并维护更新相关数据库具有非常重要的研究意义。本数据库拟旨在通过全面了解AMPs序列在物化特性、结构和活性等方面的信息对新药研究和开发提供指导。

二、拟研究的问题

综上所述，全面了解AMPs序列在物化特性、结构和活性等方面的信息对研究和开发新药十分必要。因此建立并管理维护一个详尽的数据库和便于用户访问的网站有着重要的应用价值。