基于模板随机嵌合生长法改造天冬酰胺酶分子文献综述

 2023-02-03 09:02

研究或解决的问题:天冬酰胺酶(Asp)是治疗急性淋巴细胞白血病(ALL)的关键药物之一。

临床使用的天冬酰胺酶为外源蛋白,有免疫原性,其他一些非免疫相关的毒副反应,与抑制蛋白质合成密切相关,如:急性胰腺炎、凝血功能紊乱(血栓形成或出血)、高糖血症、高甘油三酯血症、胆红素升高、转氨酶升高、低蛋白血症等。

重组门冬酰胺酶制备常用于本科实验教学,也存在酶活低等问题。

本课题是采用基于DNA shuffling技术的模板随机嵌合生长法,对L-天冬酰胺酶基因进行改造,以获得酶活性高和免疫原性低的酶分子,来降低临床使用的L-天冬酰胺酶的副作用,同时优化本科实验教学。

采取的研究手段:本研究拟采用模板随机嵌合生长方法(RAISE方法)。

随机片段交换法(RAISE法)是一种新的突变文库构建方法,它汇集了多种DNA序列的突变形式,各种形式可以单独发生,也可以同时发生。

(1)以 RAISE法替代易错PCR构建基因突变文库,不仅可以简化操作步骤,同时又能增强突变文库的多样性,大大提高定向筛选的效率。

(2)该方法除了在自身引物PCR步骤之前的加尾一步,其余均与DNA shuffling类似,但与DNA shuffling相比,它无需从一组含点突变的基因或基因家族出发,可直接以单个基因为父本,而且它产生的突变强度大于DNA shuffling,除包含点突变、区域交换外,还可产生随机序列的插人或删除等,从而提高突变文库的多样性。

RAISE的方法:首先常规PCR扩增待突变基因,接着用DNase I消化,获得一系列大小在100-300bp之间的DNA碎片,然后在末端脱氧转移酶(TdT)的作用下,DNA碎片的3末端被随意加上一个至几个碱基,随后这些带3-尾巴的短片段互为引物进行PCR重新组装,这时在随机加尾处可产生3种类型的序列变化,即随机片段插人和碱基替换、碱基替换、随机片段删除和碱基替换。

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