耐糠与易糠干制加工型萝卜的差异转录组分析文献综述

文献综述

文 献 综 述摘要：萝卜作为一种我国普遍种植的农作物，具有十分重要的生产意义和商品价值。

但是由于生长贮存过程中，水分温度等环境因素的影响，产品往往会出现糠心的病变，肉质根重量减轻，营养成分含量减少，大大损害其经济效益。

本课题以此为出发点，利用转录组测序技术建立耐糠与易糠萝卜不同组织的基因组文库，进行差异转录组分析，比较不同组织中基因上调和下调的表达模式，对相关影响其肉质根发育的基因进行挖掘，再利用实时荧光定量PCR技术进行基因的表达验证，最后利用基因工程的手段改良作物，从而培育出耐糠的新品种，提升其商品经济效益。

关键词：糠心萝卜；差异转录组；RNA-seq；实时荧光定量PCR1.糠心萝卜的简介1.1 萝卜糠心的形成机理 糠心现象主要发生于肉质根形成的中后期和贮藏期间。

随着肉质根的生长膨大，薄壁组织充分发育，而在靠近输导组织的地方，由于大型薄壁细胞生长过快，内含物迅速降低，输导组织缺乏可供给的营养物质，使得薄壁细胞处于饥饿状态，气泡和细胞空隙随之产生，导致肉质根膨大，最后形成空心即糠心[1,2],而萝卜生长中期高温诱导和周围活跃木质素也被认为是形成糠心的主要原因[3~5]。

1.2 影响萝卜糠心的因素影响萝卜糠心的因素来自于各个方面。

在Kano的研究中发现，夏季播种的随着萝卜的播种期推糠心发生的概率也随之降低，并且发现在萝卜生长周期中7月的高地表温度也对其肉质根生长过程中糠心形成有重要影响，因此认为在萝卜生长周期期间气温高而地温低可以降低糠心的发生[6，7]。

川城吴夫(1985)研究表明,有利于肉质根膨大的条件如湿润、土壤松软等都有利于糠心的形成,反之则不利于糠心的形成[8]。

此外斋藤隆(1957)研究表明在短日照条件下,肉质根膨大受到抑制,糠心发生情况较少。