基于基因表达芯片的胃癌相关信号通路分析开题报告

1. 研究目的与意义

胃癌是世界上最常见的恶性肿瘤之一，在我国其死亡率很高。胃癌患者的预后往往很差，复发和转移是胃癌患者预后差和导致患者死亡的根本原因。因此研究胃癌发生发展的分子机制对于临床肿瘤患者的早期诊治具有十分重要的意义。肿瘤的发生发展受多种因素调控，是多种生物分子和信号通路相互作用的复杂的生物学过程。

胃癌的发病原因通常有地域环境及饮食生活因素、幽门螺杆菌感染、癌前病变以及遗传和基因。早期胃癌多数病人无明显临床症状，少数人有恶心、呕吐或是类似溃疡病的上消化道症状。疼痛与体重减轻是进展期胃癌最常见的临床症状。病人常有较为明确的上消化道症状，如上腹不适、进食后饱胀，随着病情进展上腹疼痛加重，食欲下降、乏力。根据肿瘤的部位不同，也有其特殊表现。

胃癌的诊断方法通常有以下几种：x线钡餐检查、纤维胃镜检查、腹部超声、螺旋ct与正电子发射成像检查，而治疗方法通常采用手术治疗、化疗、放疗、热疗、免疫治疗以及中医中药治疗。传统的研究方法一次只能检测一个或几个基因，很难诠释肿瘤形成的全部过程。基因芯片技术结合了医学分子生物学、工程学及生物信息学等技术精华，通过自我完善，在基因诊断、分子分型、药物筛选及预后分析等诸多领域的应用正不断加强。这一技术在揭示胃癌错综复杂的分子调控网络方面的独特作用，也为人类早日认清胃癌分子本质找到预防方法奠定了基础。

2. 研究内容和预期目标

研究内容

(1) 基因表达芯片数据的收集以及预处理；

(2) 不同统计方法寻找差异基因的效果比较；

3. 研究的方法与步骤

方法：

(1) 基因表达芯片数据的收集以及预处理；

(2) 不同统计方法寻找差异基因的效果比较；

4. 参考文献

[1] xu, l., d. geman, and r.l. winslow,large-scale integration of cancer microarray data identifies a robust commoncancer signature. bmc bioinformatics, 2007. 8: p. 275.

[2] cahan, p.,et al., meta-analysis of microarray results: challenges, opportunities, andrecommendations for standardization. gene, 2007. 401(1-2): p. 12-8.

[3] rhodes, d.r., et al., large-scale meta-analysis of cancermicroarray data identifies common transcriptional profiles of neoplastictransformation and progression. proc natl acad sci u s a, 2004. 101(25): p.9309-14.

5. 计划与进度安排

1、2022-03-10～2022-03-23 进行数据收集，熟悉相关程序软件，数据的的预处理等。

2、2022-03-24～2022-04-06 不同统计方法寻找差异基因的效果比较；择优采用统计算法选出胃癌不同期间差异表达基因；