TtgV的突变研究开题报告

 2022-02-21 19:44:28

1. 研究目的与意义

有机溶剂有严重破坏微生物正常生理功能的毒害作用,而细胞膜是溶剂毒性作用的主要靶点。1989年,关于菌种Pseudomonas putida的有机溶剂耐受现象的报道,开辟了人们对有机溶剂耐受机制理解的纪元。耐有机溶剂微生物是一类新颖的极端微生物,它们通过各种耐受机制,有效抵御或降低有机溶剂对其细胞产生的毒害作用,机制包括:囊泡外排、改变细胞膜磷脂结构组成、有机溶剂外排泵、改变细胞比表面积等,而其中以有机溶剂外排机制为最重要。在恶臭假单胞菌中存在的有机溶剂外排泵主要有:TtgABC、TtgDEF、TtgGHI,它们被各自的调节蛋白所调节。其中TtgABC的阻遏蛋白是TtgR,TtgDEF的阻遏蛋白是TtgT,TtgGHI的阻遏蛋白是TtgV。在同时含有TtgGHI和TtgDEF的细胞中,调节蛋白TtgV和TtgT共同调节外排泵TtgGHI和TtgDEF的表达。调节蛋白TtgV可以被诱导表达,而调节蛋白TtgT是组成型表达。有文献报道外排泵泵TtgGHI可以被有机溶剂如甲苯诱导。在甲苯存在时,外排泵TtgGHI的表达上调,但同时也观察到外排泵TtgABC的表达下调,这说明它们之间的调控存在着某种联系,而这势必与它们的功能有关。研究发现在当外排泵TtgABC被失活以后,外排泵TtgGHI的调节蛋白TtgV会发生突变,本论文旨在研究调节蛋白TtgV的突变情况。包括突变率和突变的机制等。

目的、意义:

对调节蛋白TtgV的研究,可以增加对该调节蛋白的认识,同时有助于了解外排泵TtgABC和TtgGHI的功能上的联系。

2. 研究内容和预期目标

研究内容:

1.调节蛋白ttgv的突变率。

2.调节蛋白ttgv的突变方式。

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3. 研究的方法与步骤

方法与步骤:

1. 活化菌株,涂布在含有氨苄的LB平板上,计数细胞。同时将细胞涂布在LB平板上,计数总细胞数。根据两平板的细胞数,计数出突变率。

2. 挑取突变细胞,PCR扩增ttgV,送产物去测序,根据测序结果与已知的ttgV序列比较分析突变类型。

4. 参考文献

1.aravalli, n. r. growth of gram-negative bacteriain the presence of organic solvents. enzym. microb. tech. 1996.19:606-613.

2. fillet, s., c. daniels, et al. (2012)."transcriptional control of the main aromatic hydrocarbon efflux pump inpseudomonas." environmental microbiology reports 4(2): 158-167.

3.inoue, a. and k. horikoshi. a pseudomonasputida thrives in high concentrations of toluene. nature. 1989. 338:264-266.

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5. 计划与进度安排

1. 2022年12月25日—2022年3月9日 参阅参考文献制定具体的实验方案。准备实验药品和器具,未使用过的仪器学会正确操作使用。

2. 第1周 2022.3.5—3.11 接受任务书,与指导教师见面,就课题确定开题报告的重点和注意点,查阅相关文献。

3. 第2周—第4周 2022.3.12—3.30 梳理归纳相关文献要点,了解实验目的与意义,明确整理实验思路。综合相关文献资料,撰写开题报告。

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